采用分子动力学模拟探究VWF-A1突变体G561S的亲和力变化机制

• 作者: 刘广建 刘文平 吴建华 方颖 李红
• 来源期刊: 医用生物力学
• 学科: 医学
• 关键词: 血管性血友病因子 亲和力 分子动力学
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 433-439
• 页数: 7页
• 分类号: R318.01
• 字数: 5199字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3871/j.1004-7220.2015.05.433

摘要

目的 探究血管性血友病因子(von Willebrand factor,VWF)突变体G561S下调VWF-A1与其配体亲和力的分子机制.方法 分别构建2M型突变体G561S-A1(功能减弱型)、WT-A1(野生型)和2B型突变体R543Q-A1(功能增强型)3个分子系统.G561S-A1突变体采用将野生型A1结构的Gly561替换为Ser561的方式构建,WT-A1与R543Q-A1晶体结构取自蛋白质数据库(protein data bank,PDB).利用自由分子动力学模拟方法对比分析WT-A1、G561S-A1、R543Q-A1三者构象的改变、柔性的变化以及氢键/盐桥的形成与演化.结果 G561S突变通过降低A1结构域α2螺旋的柔性,并增强N末端与body区的相互作用从而减弱其与配体GPIbα的亲和力,R543Q功能增强型突变体则启动了一条相反的调节路径.结论 局部动力学性质的改变是A1亲和力调控的潜在机制,研究结果有助于针对激活的A1结构域的变构药物设计以及相关抗血栓药物的研发.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方颖	华南理工大学生物科学与工程学院	25	53	4.0	6.0
2	李红	华南理工大学生物科学与工程学院	16	80	5.0	8.0
3	吴建华	华南理工大学生物科学与工程学院	22	154	6.0	12.0
4	刘文平	华南理工大学生物科学与工程学院	4	4	1.0	2.0
5	刘广建	华南理工大学生物科学与工程学院	3	6	2.0	2.0