多氯联苯胁迫下红树蚬荧光定量 PCR 内参基因的筛选

• 作者: 廖思明 杨明柳 莫祖英 车志群 阎冰
• 来源期刊: 广西科学
• 学科: 地球科学
• 关键词: 红树蚬 实时荧光定量 PCR 内参基因 多氯联苯胁迫
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 海洋微生物学
• 页码范围: 350-356
• 页数: 7页
• 分类号: X171.5
• 字数: 4213字
• 语种: 中文

摘要

【目的】筛选出多氯联苯(PCBs)胁迫下红树蚬(Polymesoda erosa )的实时荧光定量 PCR(qRT-PCR)最适内参基因,为进一步开展分子毒理学研究奠定基础。【方法】以β-actin 、18S rRNA 、GAPDH 和 a-tubulin 为候选内参基因,qRT-PCR 测定 PCBs 胁迫下4个候选内参基因在红树蚬外套膜、鳃、闭壳肌和肝胰腺组织中的表达水平,应用 geNorm、NormFinder 和 BestKeeper 软件分析其表达稳定性。【结果】geNorm 软件分析表明β-actin表达最稳定；NormFinder 软件分析发现,外套膜、鳃和肝胰腺组织中β-actin 的稳定性最好,闭壳肌组织中β-actin (0.454)表达稳定性略微低于 a-tubulin (0.425),排第2位；BestKeeper 软件分析表明,外套膜和鳃组织中β-actin 最稳定,肝胰腺和闭壳肌组织中 GAPDH 最稳定,β-actin 排位第2位。【结论】筛选β-actin 为红树蚬在PCBs 胁迫下的 qRT-PCR 最适内参基因。