六溴环十二烷胁迫下红树蚬荧光定量PCR内参基因稳定性分析

• 作者: 刘文爱 孙仁杰 廖思明 车志群 阎冰
• 来源期刊: 广西科学院学报
• 学科: 地球科学
• 关键词: 红树蚬 六溴环十二烷 内参基因 稳定性分析
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 242-249
• 页数: 8页
• 分类号: X171.5
• 字数: 4691字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13657/j.cnki.gxkxyxb.20180807.001

摘要

[目的]筛选出不同浓度六溴环十二烷(HBCD)胁迫下红树蚬(Polymesoda erosa)实时荧光定量PCR(qRT-PCR)的最适内参基因,用以准确校准目的基因的表达,为进一步开展分子毒理研究和开发分子生物标志物奠定基础.[方法]通过荧光定量PCR技术监测候选内参18S核糖体RNA(18S rRNA)、β-肌动蛋白(β-actin)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)、α-微管蛋白(a-tubulin)等管家基因,在红树蚬各组织受不同浓度(0μg/L、0.86 μg/L、8.6μg/L)六溴环十二烷(HBCD)胁迫后的表达量,利用qRT-PCR及geNorm、NormFinder、BestKeeper等分析软件对不同条件下的表达数据进行处理,从而筛选出适合荧光定量PCR的最佳内参基因.[结果]受不同浓度HBCD胁迫后,鳃及肝胰中各管家基因的表达稳定性排序整体为β-actin =a-tubulin＞GAPDH＞185 rRNA.[结论]可单独或共同使用两个内参基因(β-actin、α-tubulin)校准荧光定量结果.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	廖思明		8	43	3.0	6.0
2	刘文爱	广西科学院广西红树林研究中心广西红树林保护与利用重点实验室	28	116	6.0	8.0
3	孙仁杰	广西科学院广西红树林研究中心广西红树林保护与利用重点实验室	5	4	1.0	2.0
4	阎冰	广西科学院广西红树林研究中心广西红树林保护与利用重点实验室	8	8	1.0	2.0
5	车志群	广西科学院广西红树林研究中心广西红树林保护与利用重点实验室	3	4	1.0	2.0