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摘要:
为探明山羊睾丸和附睾头β防御素家族基因表达特点及其蛋白的特性.利用3只7日龄羔羊睾丸和3只成年种公羊睾丸和附睾头的Illumina HiSeqTM2000高通量转录组测序数据,筛选出β防御素家族基因并进行差异表达基因比较分析,利用生物信息学对β防御素家族蛋白特性进行预测.结果显示:在山羊7日龄睾丸、成年睾丸和附睾头中分别表达7、12和33种β防御素,其表达量最高的分别是gDB123、gDB119和gDB124,成年睾丸中特异性表达是gDB33,附睾头中特异表达有21种β防御素.山羊β防御素分子量在6.89~13.85 ku,为小分子、极性、带正电荷、疏水性的强碱性多肽.山羊β防御素也是含高度保守6个半胱氨酸的空间构象,基本结构-C-X2-45-C-X3-6-C-X3-13-C-X4-7-CC-,其中24种β防御素结构为-C-X5,6-C-X3,4-C-X9-C-X5,6-CC-.有16种β防御素是分泌型糖蛋白,除gDB126无磷酸化位点外,其余的β防御素蛋白均有磷酸化位点.山羊附睾头特异性高度表达有丰富β防御素,它们是一类抗微生物的阳离子肽,在精子成熟过程中形成精子膜上糖被,或精子运动获得的过程中发挥重要作用;也可作为信号分子,某些信号通路中发挥作用.
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文献信息
篇名 山羊睾丸和附睾头β防御素家族的表达谱及生物信息学分析
来源期刊 畜牧兽医学报 学科 农学
关键词 β防御素家族 表达谱 生物信息、睾丸 附睾 公山羊
年,卷(期) 2015,(7) 所属期刊栏目 遗传繁育
研究方向 页码范围 1122-1133
页数 12页 分类号 S827.2
字数 6052字 语种 中文
DOI 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.07.007
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 任有蛇 山西农业大学动物科技学院 150 714 13.0 18.0
2 张春香 山西农业大学动物科技学院 137 599 13.0 16.0
3 姜玉锁 山西农业大学动物科技学院 62 265 8.0 15.0
4 郑亚琳 山西农业大学动物科技学院 7 29 3.0 5.0
5 张彩霞 山西农业大学动物科技学院 8 33 4.0 5.0
6 杜海燕 山西农业大学动物科技学院 20 79 5.0 8.0
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研究主题发展历程
节点文献
β防御素家族
表达谱
生物信息、睾丸
附睾
公山羊
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
畜牧兽医学报
月刊
0366-6964
11-1985/S
大16开
北京海淀区圆明园西路2号
82-453
1956
chi
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62883
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