二穗短柄草BURP家族基因的鉴定与分析

• 作者: 叶子弘 李金枝 林乐 管铭 蒋明
• 来源期刊: 麦类作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 二穗短柄草 BURP 基因家族 鉴定
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 1208-1214
• 页数: 7页
• 分类号: S519|S330
• 字数: 3540字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1009-1041.2015.09.05

摘要

BURP是一类植物特有蛋白,在生长发育和逆境防御中起着重要作用.为给后续的基因克隆、表达和功能验证奠定基础,根据二穗短柄草的基因组和蛋白质序列,利用生物信息学手段对BURP基因家族成员进行鉴定、染色体定位、序列分析和系统发育研究.结果表明,二穗短柄草有12个BURP基因,位于1～4号染色体上,在5号染色体上未见分布;BURP基因的全长为621～3 350 bp,具0～3个内含子,编码区全长621～2 316 bp,编码206～771个氨基酸,推导蛋白的等电点为5.02～9.51;12个BURP基因编码的蛋白分为5组,分别定名为RD22、PG1β、BURP-Ⅴ、BURP-Ⅵ和BURP-Ⅶ,没有USP和BNM2类型的BURP蛋白;此外,根据4个半胱氨酸-组氨酸重复所间隔的氨基酸数量,二穗短柄草的BURP蛋白结构域可用CH/R-X10-CH-X25-36-CH-X22-25-CH-X8-W/F表示.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶子弘	中国计量学院浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室	59	329	10.0	15.0