牛卵泡ODF1与ODF2转录组发育相关基因筛选及表达差异分析

• 作者: 刘岩 姚晓磊 姜晓龙 孟金柱 朱芷葳 李鹏飞 谢建山 赵妙妙 陈建伟
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牛 ODF1 ODF2 转录本 卵泡发育 基因
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 1961-1966
• 页数: 6页
• 分类号: S823.2
• 字数: 3935字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.11.007

摘要

旨在从牛发情周期第一卵泡波中最大卵泡ODF1 (The largest follicle at onset of deviation)和第二大卵泡ODF2(The second largest follicle at onset of deviation)转录组水平上筛选卵泡发育差异表达基因.采集牛发情周期第一卵泡波ODF1和ODF2,分别分离颗粒细胞并提取总RNA,构建RNA文库,通过Illumina平台对ODF1和ODF2测序;筛选出ODF1与ODF2两个转录本之间比值大于2的差异表达基因,并采用qRT-PCR对筛选出的基因在牛发情周期内第一卵泡波优势卵泡(Dominant follicles,DF)和从属卵泡(Subordinate follicles,SF)颗粒细胞中功能验证.共获得8个卵泡发育差异表达基因,其中7个基因筛选自ODF1/ODF2(BEX2、UBN1、SIK1、SPARCL1、LOC784256、LOC789231和LOC785462),1个筛选自ODF2/ODF1 (SAFB2);qRT-PCR结果表明,BEX2、UBN1、LOC784256和LOC789231在DF中mRNA表达量极显著高于SF(P＜0.01),SAFB2在SF中mRNA表达量极显著高于DF(P＜0.01),SIK1和SPARCL1在SF中mRNA表达量显著高于DF(P＜0.05),虽然LOC785462在SF中mRNA表达量高于DF,但差异不显著(P＞0.05).qRT-PCR检测BEX2、UBN1、LOC784256、LOC789231和SAFB2的结果与高通量测序中该基因在ODF1和ODF2的RPKM的差异趋势基本一致,而SIK1、SPARCL1和LOC785462不一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱芷葳	山西农业大学生命科学学院	54	223	7.0	13.0
2	李鹏飞	山西农业大学生命科学学院	65	175	7.0	9.0
3	姚晓磊	山西农业大学动物科技学院	32	108	6.0	8.0
4	谢建山	山西农业大学动物科技学院	16	71	5.0	8.0
5	姜晓龙	山西农业大学动物科技学院	8	25	3.0	4.0
6	孟金柱	山西农业大学动物科技学院	8	16	3.0	3.0
7	刘岩	山西农业大学动物科技学院	6	12	2.0	3.0
8	陈建伟	山西农业大学动物科技学院	10	25	3.0	4.0