基于Illumina平台转录组测序筛选牛卵泡发育调控基因

• 作者: 吕丽华 景炅婕 朱芷葳 李鹏飞 郝庆玲
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 牛 卵泡 颗粒细胞 转录组 调控基因
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产
• 页码范围: 60-67
• 页数: 8页
• 分类号: S823
• 字数: 3268字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13331/j.cnki.jhau.2019.01.011

摘要

运用超声波监测技术,采集母牛发情期出现偏差前的第一大卵泡PDF1和出现偏差后的第二大卵泡ODF2,分别分离卵泡颗粒细胞(GCs),构建RNA文库,用Illumina 2000测序;测序结果经数据库搜索和差异表达筛选,采用DAVID软件GO和KEGG pathway分析,经Genecards功能查询,筛选牛卵泡发育相关基因.结果表明:数据库搜索共获得35325个基因,其中有意义的表达基因15645个,从中筛选获得差异表达基因608个;GO分析表明,608个差异表达基因中参与生物过程的基因占60.46％,细胞组分的基因占20.08％,分子功能的基因占11.46％;KEGG pathway分析表明,608个差异表达基因通过9条信号通路参与牛卵泡发育调控(P<0.05),经Genecards功能筛选,共获得11个与牛卵泡发育密切相关的调控基因——SESN3、COL3A1、CCNE1、CAV1、CACNA1H、ITPR1、PIK3R3、MYC、PTGFR、CDK6、GAPDH,它们直接参与细胞增殖分化及信号通路调节.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吕丽华	山西农业大学动物科技学院	67	172	7.0	8.0
2	朱芷葳	山西农业大学生命科学学院	54	223	7.0	13.0
3	李鹏飞	山西农业大学生命科学学院	65	175	7.0	9.0
4	郝庆玲	山西农业大学生命科学学院	10	11	2.0	2.0
5	景炅婕	山西农业大学动物科技学院	23	51	5.0	5.0