制干辣椒SCoT-PCR体系优化及引物筛选

• 作者: 余庆辉 唐亚萍 帕提古丽 李宁 杨涛 杨生保 王强 王柏柯
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 制干辣椒 SCoT标记 正交设计 体系优化
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
• 页码范围: 544-549
• 页数: 6页
• 分类号: S641.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2015.4.544

摘要

[目的]优化制干辣椒SCoT-PCR反应体系,为新疆制干辣椒种质资源、分子遗传学研究奠定基础.[方法]以制干辣椒为材料,采用L25(55)正交设计方法对影响制干辣椒SCoT-PCR反应体系的Mg2+、模板DNA、引物、DNA聚合酶、dNTPs等因素进行优化筛选.[结果]从25个正交设计组合中筛选获得5个组合的扩增效果较好,扩增条带丰富且清晰度适中、分散性好;经引物SC-12、SC-13、SC-19筛选,获得适用于制干辣椒材料的SCoT-PCR最佳反应体系20.0 μL,包含10×Buffer 2.0 μL、30 ng模板DNA 0.8 μL、2.0 mmol/L Mg2+ 1.8μL、1.0 μmol/L引物1.0 μL、1 U Taq DNA聚合酶0.4μL、0.25 mmol/L dNTPs 0.5 μL、ddH2O 13.5 μL.运用优化体系从80条引物中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SCoT引物24条.[结论]优化的SCoT-PCR反应体系及筛选的引物可用于新疆制干辣椒种质鉴定、遗传图谱构建、遗传多样性的分析等.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李宁	新疆农业科学院园艺作物研究所	52	341	10.0	17.0
2	杨涛	新疆农业科学院园艺作物研究所	85	384	12.0	16.0
3	王柏柯	新疆农业科学院园艺作物研究所	34	114	7.0	9.0
4	王强	新疆农业科学院园艺作物研究所	50	430	8.0	20.0
5	帕提古丽	新疆农业科学院园艺作物研究所	28	122	6.0	10.0
6	杨生保	新疆农业科学院园艺作物研究所	29	112	7.0	10.0
7	唐亚萍	新疆农业科学院园艺作物研究所	16	31	4.0	5.0