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基于ITS和IGS1序列分析对云南牛肝菌的分类鉴定
基于ITS和IGS1序列分析对云南牛肝菌的分类鉴定
作者:
岳万松
熊勇
王燕彩
陈毅坚
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
牛肝菌
ITS序列
IGS1序列
分子鉴定
摘要:
以采自云南地区的5个牛肝菌(Boletus sp.)样品为材料,根据样品的形态特征,并结合rDNA ITS和IGS1序列分析对5个样品进行分类鉴定,通过与GenBank上已登录的牛肝菌序列比对,采用邻接法(neighbor-joining,N-J)构建系统发育树.结果表明,所有供试材料的ITS和IGS1全长分别在739~787bp和537~583bp范围内,GC含量分别在48.31%~51.01%和48.42%~52.89%之间,遗传距离在0.017~0.248和0.002~0.225之间,上述数据表明云南5个牛肝菌样品之间存在一定的遗传差异.5个牛肝菌样品的ITS和IGS1序列聚类分析均表明,供试样品被分为两大类,其中样品YX1-2和QJ3-4聚为一个类群,样品CX2-10、QJ3-5和YX1-3聚为另一个大的类群,两种分析手段相互印证,且ITS序列聚类分析能将云南不同地点的牛肝菌鉴定到属甚至种的水平,上述分析结果表明ITS和IGS1序列分析相结合可作为牛肝菌亲缘关系鉴定的有效分子标记方法.
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牛肝菌
内生真菌
ITS序列
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内容分析
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文献信息
篇名
基于ITS和IGS1序列分析对云南牛肝菌的分类鉴定
来源期刊
食品工业科技
学科
工学
关键词
牛肝菌
ITS序列
IGS1序列
分子鉴定
年,卷(期)
2015,(8)
所属期刊栏目
生物工程
研究方向
页码范围
186-190
页数
分类号
TS201.1
字数
语种
中文
DOI
10.13386/j.issn1002-0306.2015.08.030
五维指标
作者信息
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姓名
单位
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熊勇
云南民族大学化学与生物技术学院
17
63
5.0
7.0
2
岳万松
云南民族大学化学与生物技术学院
2
2
1.0
1.0
3
王燕彩
昆明理工大学环境科学与工程学院
5
8
2.0
2.0
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IGS1序列
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研究去脉
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食品工业科技
主办单位:
北京一轻研究院
出版周期:
半月刊
ISSN:
1002-0306
CN:
11-1759/TS
开本:
大16开
出版地:
北京永外沙子口路70号
邮发代号:
2-399
创刊时间:
1979
语种:
chi
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200094
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