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摘要:
为建立快速检测鲑鱼甲病毒(Salmonid alphavirus,SAV)RT-PCR方法,根据GenBank公布的E2基因序列(1 375 bp)设计引物,扩增SAV E2全长基因,利用假病毒制备技术获得包裹E2核酸物质(RNA)的SAV假病毒溶液.以SAV假病毒作为阳性核酸物质质控品,以E2F:5' CCG-TTG-CGG-CCA-CAC-TGG-ATG 3’,E2R:5'CCT-CAT-AGG-TGA-TCG-ACG-GCA-G 3'为引物,优化反应条件,建立SAV的RT-PCR检测方法.结果表明,该方法可扩增SAV E2特异性516 bp的DNA片段,引物最适反应浓度为1.0μmol·L-1,最佳退火温度为57.5℃,对SAV的三种亚型SAV1 (V4640)、SAV2(V4619)、SAV5(V4638)检测结果均为阳性,对SVCV、IHNV和IPNV的PCR扩增结果均为阴性;并确定对SAV的核酸最低检出量达1.59 pg;以RT-PCR方法在不同时间对每份样品作3次重复检测,检测结果一致.表明此方法特异性强,敏感性高,稳定性和重复性较好,可用于SAV临床诊断和检测.
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内容分析
关键词云
关键词热度
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文献信息
篇名 鲑鱼甲病毒阳性核酸物质制备及RT-PCR检测方法的建立
来源期刊 东北农业大学学报 学科 农学
关键词 鲑鱼甲病毒 SAVE2 核酸物质 RT-PCR 检测方法
年,卷(期) 2016,(7) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 56-62
页数 7页 分类号 S942.3
字数 4151字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 李一经 东北农业大学动物医学学院 219 1679 20.0 27.0
2 唐丽杰 东北农业大学动物医学学院 90 615 13.0 20.0
3 刘敏 东北农业大学动物科学与技术学院 57 476 12.0 20.0
4 杜航 东北农业大学动物科学与技术学院 2 3 1.0 1.0
5 宋傲臣 东北农业大学动物科学与技术学院 2 3 1.0 1.0
6 高帅 东北农业大学动物科学与技术学院 2 3 1.0 1.0
7 蒋烨 东北农业大学动物科学与技术学院 2 3 1.0 1.0
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鲑鱼甲病毒
SAVE2
核酸物质
RT-PCR
检测方法
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大16开
哈尔滨市木材街59号
14-47
1957
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