27-plex SNPs复合扩增检测体系构建与应用评价

• 作者: 孙启凡 李彩霞 江丽 王英元 魏丽 魏以梁
• 来源期刊: 中国法医学杂志
• 学科: 政治法律
• 关键词: 法医物证学 SNPs 复合扩增 多态性分析
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 13-17
• 页数: 5页
• 分类号: DF795.2
• 字数: 2810字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13618/j.issn.1001-5728.2016.01.004

摘要

目的 建立27个常染色体SNPs复合检测体系,用于未知个体种族来源推断.方法 通过对Hap Map数据库中描述祖先(非洲、欧洲、东亚)的遗传标记信息分析,选出27个SNPs位点,构建27个SNPs复合扩增体系;采用该体系对17个不同祖先人群的1 164份样本进行测试,得到的分型数据和在HapMap数据库查询到的11个相关人群的数据;采用据聚类分析方法(K=3)进行祖先成分和匹配率计算,分析推算样品9947A的祖先来源,并进行体系性能验证.结果 该体系可以进行单一和混合人群的种族来源和种族成分推断,来自新疆的人群遗传成分呈现在欧洲与东亚祖先之间连续分布,样品9947A祖先成分和匹配率与相关文献分析结果一致.浓度最低为0.1ng/μL时27个等位基因均可正确判型.结论 本文构建的27-plex SNPs复合体系可以精确推断非洲、欧洲、东亚血统的个体祖先起源,且对欧亚混合人群(欧洲/东亚)有较好的推断能力,可在相关研究和实践中选择使用.