刺五加MDD基因启动子的克隆与生物信息学分析

• 作者: 国红玉 尤鹏升 李志栋 杨果 邢朝斌 龙月红
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 刺五加 MDD基因 启动子 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2016,（21）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 3871-3875
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2016.21.020

摘要

目的 克隆并分析刺五加甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶(mevalonate diphosphate decarboxylase,MDD)基因的启动子序列.方法 根据刺五加MDD基因的cDNA序列,采用PCR扩增和热不对称交错PCR (TAIL-PCR)技术,克隆MDD基因5’端的DNA序列及启动子序列.利用PlantCARE等软件对其进行生物信息学分析.结果 克隆得到长1 423 bp的刺五加MDD基因启动子序列及长1 024 bp的5’端DNA序列.该启动子序列含有49个TATA-box、25个CAAT-box.还含有脱落酸响应元件、茉莉酸甲酯响应元件、胚乳表达必须顺式作用元件、干旱胁迫响应元件、光响应元件等多种顺式作用元件,以及2个MYBHv1与2个MBY结合位点.结论 首次克隆并分析了刺五加MDD基因的启动子序列,为该基因的表达调控奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邢朝斌	华北理工大学生命科学学院	28	59	5.0	6.0
2	国红玉	华北理工大学生命科学学院	10	15	2.0	3.0
3	李志栋	华北理工大学生命科学学院	6	20	3.0	4.0
4	尤鹏升	华北理工大学生命科学学院	8	14	2.0	3.0
5	龙月红	华北理工大学生命科学学院	17	38	4.0	5.0
6	杨果	华北理工大学生命科学学院	3	10	2.0	3.0