基于转录组信息的艾纳香牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因（BbGGPS）的克隆及序列分析

• 作者: 刘红昌 夏奇峰 官玲亮 庞玉新 赵致
• 来源期刊: 山地农业生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 艾纳香 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶 氨基酸序列 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 23-29
• 页数: 7页
• 分类号: Q756
• 字数: 4598字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15958/j.cnki.sdnyswxb.2016.04.005

摘要

采用RT-PCR和RACE(Rapid amplification of cDNA ends)技术,从艾纳香(Blumea balsamifera L·DC)的叶片中克隆到二萜化合物合成的关键酶牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶( BbGGPS)基因。结果显示：BbGGPS基因的cDNA全长1475 bp,包含开放阅读框( ORF)1002 bp,编码334个氨基酸；亚细胞结构定位于叶绿体,既非膜蛋白也非分泌性蛋白。疏水性分析显示,BbGGPS是亲水性蛋白。同源性比对结果显示,BbGGPS蛋白与其他植物中GGPS蛋白具有高度的相似性。系统发育分析表明,所有序列被聚为5大类, BbGGPS与菊科植物刺菜蓟聚( Cynara cardunculus var)为一类,表明与其亲缘关系最近。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵致	贵州大学农学院贵州省中药材重点实验室	122	1351	19.0	33.0
2	刘红昌	贵州大学农学院贵州省中药材重点实验室	39	111	5.0	9.0
3	庞玉新	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室/海南省艾纳香工程技术研究中心	28	301	8.0	17.0
4	夏奇峰	贵州大学生命科学学院	2	9	1.0	2.0