基于RNA-Seq技术的茶树花转录组分析

• 作者: 周萌 夏丽飞 宋维希 朱兴正 梁名志 田易萍 陈林波 马伟
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 转录组测序 不育基因 分子标记
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源
• 页码范围: 2058-2062
• 页数: 5页
• 分类号: S571.1
• 字数: 3061字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2016.09.009

摘要

本研究利用RNA-seq技术对父本、母本、子代不育茶树花三个样本花的转录组进行测定,经组装分析获得403 469条高质量的Unigenes.将获得的Unigenes与SWISS-PROT、TREMBL、CDD、PFAM、NR和KOG库进行blast,共注释到307 291条Unigenes.KOG功能分类显示,有23 739个Unigenes被分为25类.KEGG通路分析表明,共识别出26 967个Unigenes涉及的pathway有328个.SSR查找发现,从403 469个Unigenes中找到46 440个含有SSR序列.这些信息为茶树不育基因筛选、不育机理研究以及分子标记开发奠定了基础.