铁皮石斛RCA2基因克隆与生物信息学分析

• 作者: 崔波 张燕 王洁琼 王默霏 蒋素华
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 铁皮石斛 RCA2基因 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 80-86
• 页数: 7页
• 分类号: Q949.71
• 字数: 3928字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201606027

摘要

核酮糖1,5￣二磷酸羧化酶/加氧酶是光合碳同化作用的关键酶,它对调节铁皮石斛Rubisco活性和光合速率具有直接的作用,对其进行基因等方面的研究,会对改变植物光合速率打下良好基础。该研究以一年生铁皮石斛叶片为材料,采用 RT￣PCR和 RACE技术成功克隆了Rubisco活化酶( RCA)基因,并对其进行生物信息学分析。结果表明：RCA基因全长1730 bp,命名为RCA2( GenBank登录号KT205842),其中5′￣UTR 81 bp、3′￣UTR 326 bp,开放阅读框1323 bp,编码440个氨基酸,分子质量为48.53 kDa,等电点为6.19,包含P￣loop NTPase超家族基因结构。氨基酸多重序列比对发现RCA2核苷酸序列与蝴蝶兰的相似性高达87％。 RCA2编码蛋白为亲水性蛋白；亚细胞定位于叶绿体基质；蛋白质二级结构分析,α螺旋占30.68％,延伸链占25.45％,不规则折叠占43.86％。 RCA2编码蛋白质的功能预测发现,RCA2在中间代谢起到了一个非常重要的角色。该研究发现对铁皮石斛光合作用关键酶Rubisco 的分析可为其光合作用特性的发掘提供理论基础,并为提高温室大棚栽培效率提供理论依据。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔波	郑州师范学院生物工程研究所	93	393	10.0	13.0
2	蒋素华	郑州师范学院生物工程研究所	51	180	7.0	10.0
3	王洁琼	河南农业大学生命科学学院	15	56	4.0	6.0
4	张燕	郑州师范学院生物工程研究所	18	24	3.0	4.0
5	王默霏	郑州师范学院生物工程研究所	20	35	4.0	4.0