大肠杆菌外膜蛋白OmpC的生物信息学分析及表位多肽疫苗的重组预测

• 作者: 丁锐 俱雄 党亚锋 冯自立 刘祥 张辰露 陈琛
• 来源期刊: 河南农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 大肠杆菌 OmpC蛋白 表位疫苗 抗原分析
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 94-100
• 页数: 7页
• 分类号: Q816
• 字数: 3500字
• 语种: 中文

摘要

为设计大肠杆菌外膜蛋白OmpC的袁位多肽重组疫苗,进一步提高OmpC蛋白的免疫效果,通过生物信息学软件对OmpC蛋白的进化关系、高级结构与细胞表位进行分析.结果表明,大肠杆菌、沙门伤寒菌、肺炎克雷伯菌,这3种细菌具有较高同源性,OmpC蛋白可能对这3种菌株的感染起到交叉免疫保护作用.OmpC为亲水性蛋白,1 ～21位氨基酸为信号肽位置,无跨膜结构并定位于细胞膜外;OmpC二级结构中含无规则卷曲43.05％,a-螺旋16.08％,β-转角0％,3-片层40.87％.OmpC蛋白可能存在5个优势B细胞表位,1个CTL表位,1个Th细胞表位;并重组拼接获得抗原性较好的OmpC蛋白表位多肽.