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摘要:
扩展蛋白(expansin,EXP)是一类引起植物细胞壁松弛的蛋白质,在花开放过程花瓣细胞扩展中发挥重要作用.为了探究桂花(Osmanthus fragrans)中扩展蛋白基因在花开放中的表达特征,本研究从已构建的桂花品种‘堰虹桂’花芽转录组数据库中筛选得到12个与植物EXP基因同源性较高的Unigene序列,以盛开期花瓣为材料克隆得到其cDNA序列.通过NCBI数据库中的比对结果,将12个Unigene序列分别命名为OfEXPA1~OfEXPA8,OfEXPB1~OfEXPB2,Of EXLA1,Of EXLB1(GenBank登录号:KY968700~KY968711).BLASTX查找比对结合ORF Finder工具分析发现,除了OfEXPA1、Of EXPA5和OfEXLB1基因的cDNA序列5'端有少量缺失外,另外9个EXP基因具有cDNA全长序列.序列分析结果表明,9个全长cDNA推导的蛋白氨基酸残基数为240~274个,预测的分子量为26.06~29.7 kD,理论等电点为4.77~9.74.桂花OfEXPA1~OfEXPA8和OfEXPB1~OfEXPB2蛋白具有典型的扩展蛋白结构特征,N端含有8个保守的半胱氨酸结构域,C端含有4个保守的色氨酸结构域,其中大部分EXPA和EXPB蛋白含有组氨酸功能域HFD基序序列.Of EXLA1具有特征基序CDQC,OfEXLB1特征基序尚未见报道.qRT-PCR分析结果发现桂花12个EXP基因在‘堰虹桂’花芽不同发育过程中均有表达,其中Of EXPA1、Of EXPA3、Of EXPA5、Of EXPA6、OfEXPA7、Of EXPA8、OfEXPB1、Of EXPB2和OfEXLB1整体表达模式较为类似,花芽发育前期(B1~B6)表达量显著高于花瓣扩展期(B7~FF),在花瓣扩展期表达量逐渐下降;而Of EXPA2、Of EXPA4和Of EXLA1在花芽发育前期表达量较低,而随着花瓣显著伸展表达量急剧增加,在花瓣扩展期呈现较高的表达.结合系统进化树分析发现Of EXPA4和Of EXPA2分别与唐菖蒲(Gladiolusgrandiflorus) GgEXPA1和月季(Rosa chinensis) RhEXPA1亲缘关系较近,且Of EXPA2和Of EXPA4这两个基因与GgEXPA1和RhEXPA1基因的表达模式相似,推测这2个基因为花开放过程中的关键EXP基因家族成员;进一步根据Of EXLA1表达特征推测其亦参与调控桂花花开放.研究结果为全面理解桂花花开放机制、扩展蛋白基因功能提供理论依据.
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文献信息
篇名 桂花扩展蛋白基因家族的鉴定和表达分析
来源期刊 农业生物技术学报 学科 农学
关键词 桂花 扩展蛋白 花开放 表达分析
年,卷(期) 2017,(8) 所属期刊栏目 研究论文与报告
研究方向 页码范围 1289-1299
页数 11页 分类号 S685
字数 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1674-7968.2017.08.009
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 张超 浙江农林大学风景园林与建筑学院 44 270 8.0 14.0
2 胡绍庆 浙江理工大学建筑工程学院 41 142 7.0 10.0
3 董彬 浙江农林大学风景园林与建筑学院 13 23 3.0 3.0
4 赵宏波 浙江农林大学风景园林与建筑学院 30 133 7.0 10.0
5 付建新 浙江农林大学风景园林与建筑学院 18 63 4.0 6.0
6 罗云 浙江农林大学风景园林与建筑学院 2 7 2.0 2.0
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研究主题发展历程
节点文献
桂花
扩展蛋白
花开放
表达分析
研究起点
研究来源
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研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
农业生物技术学报
月刊
1674-7968
11-3342/S
大16开
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
2-367
1993
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
8
总被引数(次)
40364
相关基金
浙江省自然科学基金
英文译名:
官方网址:http://www.zjnsf.net/
项目类型:一般项目
学科类型:
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