基于高通量测序半夏珠芽转录组研究

• 作者: 叶德 徐涛 李东海 杨支力
• 来源期刊: 浙江理工大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 半夏 珠芽 茎 转录组 激素
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 生物与生命科学
• 页码范围: 282-288
• 页数: 7页
• 分类号: Q946.2
• 字数: 2508字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-3851.2017.03.022

摘要

利用高通量测序技术,对半夏珠芽和茎进行测序分析,共获得6.5 Gb原始数据,122 282 962条有效reads,平均长度为103.84 bp.经Denovo组装,获得90 175条unigenes,平均长度为751 bp.对长度分布、GC含量、表达水平等方面的评价显示,测序数据质量好且可信度高.将unigenes比对到NR、KOG和GO数据库,分别获得了55 197、46 237和31 622条注释信息.通过分析半夏珠芽和茎的基因表达量,共筛选出19个与玉米素、吲哚乙酸、茉莉酸、脱落酸和赤霉素代谢相关的差异表达基因.基因差异表达分析结果表明:玉米素、生长素、茉莉酸、脱落酸4种激素合成代谢相关基因在半夏珠芽中的表达水平高于茎中,而赤霉素则相反.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐涛	浙江理工大学生命科学院	37	169	6.0	11.0
2	叶德	浙江理工大学生命科学院	3	8	1.0	2.0
3	杨支力	浙江理工大学生命科学院	5	18	3.0	4.0
4	李东海	浙江理工大学生命科学院	5	17	2.0	4.0