羊口疮病毒重庆株F1L基因克隆与生物信息学分析

• 作者: 冯将 刘嫒 包细明 张益 李婷 李鹏飞 鲜思美
• 来源期刊: 西北农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 羊口疮病毒 F1L基因 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1281-1288
• 页数: 8页
• 分类号: S855.3
• 字数: 4433字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1004-1389.2017.09.003

摘要

旨在分析OrfV-CQ株F1L基因的分子特点,预测其编码蛋白的生物学功能.对OrfV-CQ株F1L基因进行PCR扩增、克隆及序列测定,利用生物信息学相关软件进行序列分析并对其编码蛋白的二级结构、B细胞表位、T细胞表位、保守结构域、跨膜结构域和信号肽进行预测.结果表明,OrfV-CQ株F1L基因长1 023 bp,编码340个氨基酸,与Shanxi株F1L基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4％和95.0％.Or-fV-CQ株F1L基因编码蛋白的α-螺旋、β-片层、β-转角、无规则卷曲分别为11.21％、10.3％、2.73％、75.76％;可能存在5个B细胞优势抗原表位,3个CTL表位,4个Th细胞表位,无跨膜结构域和信号肽.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	鲜思美	贵州大学动物科学学院	45	200	8.0	12.0
3	李鹏飞	贵州大学动物科学学院	18	44	4.0	5.0
6	冯将	贵州大学动物科学学院	14	37	4.0	5.0
7	刘嫒	贵州大学动物科学学院	13	49	5.0	6.0
8	李婷	贵州大学动物科学学院	25	46	5.0	5.0
9	包细明	贵州大学动物科学学院	9	18	3.0	4.0
10	张益	贵州大学动物科学学院	10	21	3.0	4.0