矢竹地下茎转录组测序及节间生长相关基因表达分析

• 作者: 丁雨龙 魏强
• 来源期刊: 南京林业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 矢竹 转录组 基因表达 赤霉素 细胞壁 节间生长 高生长
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 42-48
• 页数: 7页
• 分类号: S795|Q781
• 字数: 4679字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.201601006

摘要

[目的]揭示竹子地下茎生长发育的分子机制.[方法]利用高通量转录组测序对矢竹含不同发育阶段节的地下茎转录组图谱进行了分析研究,并利用qRT-PCR对节间生长相关基因进行表达模式分析.[结果]共获得了11976条平均长度为1008 bp的单基因簇(unigenes).NCBI注释显示,63.8%的单基因簇具有注释结果,其中16254条unigenes被注释到137个KEGG(京都基因与基因组百科全书)代谢通路中.MapMan分析共获得了1864个转录因子及603个激素代谢及信号转导相关单基因簇.在功能基因方面,共获得564个与细胞壁构建相关的代谢基因,其中92个与木质素合成相关.此外,对9个与赤霉素、细胞壁合成及细胞骨架组织相关的基因,通过实时荧光定量PCR,分析了它们在节间不同发育阶段的表达模式.结果显示:细胞壁、细胞骨架下游功能相关基因在矢竹地下茎节间快速生长阶段表达最高;而赤霉素合成及信号传导相关基因则在节间伸长起始阶段最高.[结论]矢竹地下茎生长发育受到从各类激素、转录因子到其下游功能基因等组成的复杂分子网络的协同调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	魏强	南方现代林业协同创新中心南京林业大学竹类研究所	1	4	1.0	1.0
2	丁雨龙	南方现代林业协同创新中心南京林业大学竹类研究所	2	9	2.0	2.0