3个品种猪MEF2D基因启动子多态及其生物信息学分析

• 作者: 何琦 张勇 张雄 李俊 杨红 白优 陆静 陈祥
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 从江香猪 MEF2D基因 SNP 启动子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 34-38
• 页数: 5页
• 分类号: S828.2
• 字数: 4251字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.2017-10-034

摘要

研究以从江香猪、柱×长×大外三元杂交猪及贵州宗地花猪为研究对象,采用混合DNA池结合直接测序技术筛选猪MEF2D基因5'UTR及第1外显子区SNPs位点;同时利用生物信息学软件分析SNPs位点对核心启动子区、CpG岛和转录因子结合位点的影响.结果表明:在猪MEF2D基因5'UTR区共筛查到4个SNPs位点,分别为A-511G、T-453A、T-242G和T-180A;生物信息学软件预测发现T-453A和T-242G位点附近有重要转录因子结合位点消失和新位点生成,据此推测猪MEF2D基因5'UTR区的T-453A和T-242G位点对调控启动子功能元件可能存在重要影响.