短管赤眼蜂Argonaute蛋白基因家族鉴定及表达分析

• 作者: 刘旭 张海燕 杨志强 梁洪宇 王丽艳 白雪萍 赵长江
• 来源期刊: 植物保护
• 学科: 农学
• 关键词: 短管赤眼蜂 Argonaute 基因家族 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 38-45
• 页数: 8页
• 分类号: S476.3
• 字数: 5287字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0529-1542.2017.06.006

摘要

动物和植物Argonaute蛋白在RNA诱导的基因沉默中发挥重要作用.本研究采用生物信息学方法在全基因组水平鉴定短管赤眼蜂Argonaute蛋白基因家族,鉴定并命名6个TpAGO蛋白.蛋白结构及系统进化分析将TpAGO家族蛋白分为PIWI和Ago两个亚家族.TpAGO蛋白二级结构的数量比例差异不大,分布却存在一定差异,其中α-螺旋分布差异尤为显著.TpAGO蛋白基因结构表现明显的多样性,基因外显子数量差异明显,从1到20个数量不等;Ka/Ks分析表明TpAGO2和TpAGO5,TpAGO3和TpAGO4两对基因间进化动力为正选择作用,其他组合间表现为纯化选择.EST表达分析发现TpAGO基因在昆虫的卵期、幼虫期、蛹期和成虫期均有不同程度的表达,而且靶向EST在同一物种中具有单一性别(雌性或雄性)表达特性,表明短管赤眼蜂TpAGO蛋白基因可参与赤眼蜂性别及发育调控.该研究不仅有助于揭示赤眼蜂产雌孤雌生殖的表观遗传机理,也有助于推动赤眼蜂等天敌的生防应用.