基于布谷鸟优化算法的全基因组关联分析

• 作者: 彭昱忠 钟诚 黄毅然
• 来源期刊: 广西大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 单核苷酸多态性(SNP) 全基因组关联分析 布谷鸟优化算法
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 计算机与电子信息科学
• 页码范围: 1114-1120
• 页数: 7页
• 分类号: TP391
• 字数: 4812字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13624/j.cnki.issn.1001-7445.2017.1114

摘要

利用贝叶斯网络描述单核苷酸多态性(SNP)与疾病之间的关系,以SNP与疾病之间的贝叶斯评分作为评价SNP与疾病关联度的目标函数,在全基因数据中通过布谷鸟优化算法对SNP与疾病之间的关联进行启发式搜索来寻找致病SNP;通过布谷鸟算法寻找致病SNP可以在保留SNP与疾病相关信息的同时,又能在全基因组数据中高效准确地找出致病SNP.实验结果表明:与已有方法相比,本文基于布谷鸟优化算法的全基因组关联分析方法具有更好的检测SNP与疾病之间关联的能力.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钟诚	广西大学计算机与电子信息学院	195	1023	14.0	21.0
2	黄毅然	广西大学计算机与电子信息学院	6	8	2.0	2.0
3	彭昱忠	复旦大学计算机科学技术学院	5	24	2.0	4.0