基于RNA-Seq转录组测序技术揭示南方黄牛肉质嫩度调控相关的分子机制

• 作者: 亏开兴 孟祥忍 张成龙 杨章平 樊永亮 毛永江 王文强 黄必志
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 南方黄牛 嫩度 转录组
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 26-32,68
• 页数: 8页
• 分类号: S823.2
• 字数: 5778字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.2017-09-026

摘要

为揭示南方黄牛肉质调控的分子机制并挖掘与肌肉嫩度相关的功能基因,本研究以1周岁左右的云岭牛、文山牛和中国西门塔尔牛为试验对象,屠宰后测定背最长肌不同排酸时间(0、1、2、3、5、7d)下剪切力变化,揭示不同黄牛品种肌肉嫩度的差异,利用RNA-Seq技术对背最长肌进行比较转录组学分析,并结合生物信息学筛选与肌肉嫩度调控相关的信号通路及差异表达基因,最后利用qPCR进行验证.结果表明:在宰后成熟过程中,黄牛肌肉嫩度表现为明显的下降趋势,且在同一个成熟时间点下,剪切力值表现为西门塔尔牛＞文山牛＞云岭牛,表明云岭牛嫩度较好,而西门塔尔牛嫩度相对较差;云岭牛与西门塔尔牛背最长肌2组文库经测序后,筛选出3 198个差异表达基因,其中云岭牛上调基因1 750个,KEGG功能注释发现2个与肉质调控相关的重要信号通路:脂肪细胞因子信号通路和内质网蛋白加工通路,结合qPCR验证、基因表达水平与剪切力值相关性分析,最终筛选出Leptin和CAPN12个可能肌肉嫩度相关的功能基因.本研究筛选与鉴定出南方黄牛肌肉嫩度相关信号通路及其关键基因,为今后南方黄牛肉质遗传改良奠定理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄必志		118	436	10.0	13.0
2	毛永江	扬州大学旅游烹饪学院	161	1081	17.0	24.0
3	杨章平	扬州大学旅游烹饪学院	200	1464	19.0	27.0
4	孟祥忍	扬州大学旅游烹饪学院	32	78	6.0	7.0
5	张成龙	扬州大学旅游烹饪学院	9	35	3.0	5.0
6	王文强	扬州大学旅游烹饪学院	17	23	3.0	4.0
7	樊永亮	扬州大学旅游烹饪学院	9	14	2.0	3.0
8	亏开兴		5	17	2.0	4.0