雨生红球藻PHOT的基因克隆和生物信息学分析

• 作者: 崔红利 王林萍 秦松 胡章立 陈军
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 向光素 cDNA全长 结构域 系统进化 雨生红球藻
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源
• 页码范围: 2639-2647
• 页数: 9页
• 分类号: S154.38+4
• 字数: 7013字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2017.12.005

摘要

[目的]本文旨在获得雨生红球藻中蓝光受体向光素(Phototropin,PHOT)的全长序列并进行生物信息分析.[方法]采用同源克隆和RACE结合的方法获得雨生红球藻中编码HaePHOT的cDNA序列全长,并对HaePHOT进行生物信息分析.[结果]HaePHOT的开放阅读框全长为2139 bp,编码712个氨基酸,预测的等电点8.66,理论分子量78.73 kD.经BLASTP程序分析,与拟南芥来源PHOT的相似性达到58％,与菜茵衣藻来源PHOT的相似性达到68％.通过序列比对和结构域分析,PHOT蛋白的典型结构域存在于HaePHOT中,包括发色团结合和激酶结构域.系统进化分析表明,高等植物和真核绿藻来源PHOTs来自供同祖先.[结论]首次从雨生红球藻中获得编码PHOT的基因序列,为下一步雨生红球藻中PHOT的表达和功能研究奠定基础,同时为解析蓝光调控雨生红球藻虾青素合成的分子机制提供线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦松	中国科学院烟台海岸带研究所海岸带生物学与生物资源利用重点实验室	179	1772	22.0	33.0
2	胡章立	深圳大学生命与海洋科学学院	68	500	13.0	18.0
3	陈军	中国科学院烟台海岸带研究所海岸带生物学与生物资源利用重点实验室	74	507	14.0	19.0
7	崔红利	大连大学生命科学与技术学院	4	5	2.0	2.0
8	王林萍	大连大学生命科学与技术学院	1	3	1.0	1.0