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摘要:
[目的]建立快速获取55型腺病毒的全长基因组序列的方法.[方法]根据55型腺病毒的基因组特点,设计覆盖55型腺病毒基因组序列的12对引物,分别以55型腺病毒DNA为模板,扩增得到12个PCR产物,通过对12个PCR产物测序及序列拼接,获得55型腺病毒的全长基因组序列.[结果]从本院急性上呼吸道感染者咽拭子标本中分离得到一株55型腺病毒毒株SF04/SC/2016,以其DNA为模板扩增成功获得12个PCR产物,对其进行测序,并对12段序列进行拼接得到55型腺病毒的全长基因组序列,与已报到的各型腺病毒序列进行比对,采用邻位相连法构建系统发育进化树,所得序列与55型腺病毒处于同一分支,进一步确认该病原体为55型腺病毒.[结论]研究公布的序列和方法,能够实现更方便对腺病毒的快速测序,为揭示55型腺病毒的进化特点及制订疾病防控策略提供了有效手段.
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文献信息
篇名 快速获取55型腺病毒基因组序列的方法
来源期刊 微生物学通报 学科
关键词 55型腺病毒 病原分离 全基因测序 序列拼接
年,卷(期) 2017,(11) 所属期刊栏目 简报
研究方向 页码范围 2708-2713
页数 6页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.13344/j.microbiol.china.170148
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 范泉水 187 838 13.0 20.0
2 冯子良 28 117 5.0 9.0
3 熊杰 成都军区总医院检验科 57 285 10.0 13.0
4 邹自英 成都军区总医院检验科 97 432 10.0 14.0
5 刘媛 成都军区总医院检验科 44 193 8.0 10.0
6 王文博 17 23 3.0 4.0
传播情况
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引文网络
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研究主题发展历程
节点文献
55型腺病毒
病原分离
全基因测序
序列拼接
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
微生物学通报
月刊
0253-2654
11-1996/Q
16开
北京朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
2-817
1974
chi
出版文献量(篇)
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68203
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