珊瑚菜Gl4CL基因克隆与生物信息学分析

• 作者: 宋洁洁 张玉 朱珣之 罗红梅 高婷
• 来源期刊: 世界科学技术-中医药现代化
• 学科: 医学
• 关键词: 珊瑚菜 4-香豆酸:辅酸A连接酶 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 技术应用研究
• 页码范围: 610-617
• 页数: 8页
• 分类号: R282.6
• 字数: 4909字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11842/wst.2017.04.011

摘要

目的:对珊瑚菜(Glehnia littoralis)4-香豆酸:辅酸A连接酶(4-Coumarate:Coenzyme A Ligase,Gl4CL)基因编码区进行克隆及序列分析.方法:本研究在前期珊瑚菜高通量测序的基础上,利用cDNA末端快速扩增(Rapid Amplification of cDNA Ends,RACE)方法对Gl4CL基因全长cDNA序列进行克隆.对Gl4CL蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析.利用实时荧光定量PCR方法检测Gl4CL基因在珊瑚菜的根、叶中的表达情况.结果:Gl4CL基因cDNA序列全长1 951 bp,编码544个氨基酸,其中开放阅读框1 635 bp,5'非编码区153 bp,3'非编码区163 bp.生物信息学分析表明,G14CL蛋白大小约为59.481 kDa,等电点为8.20.Gl4CL基因在珊瑚菜的根和叶均存在表达,且在根中表达量显著高于叶.结论:本研究为进一步开展Gl4CL基因功能和遗传调控研究奠定基础,通过深入探讨Gl4CL基因的表达调控与木质素、植株生长表型等关系,有望获得抗病虫害、抗逆性强的北沙参高产优质品系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱珣之	江苏科技大学生物与化学工程学院	9	78	4.0	8.0
2	高婷	青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物重点实验室	13	41	4.0	5.0
3	宋洁洁	青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物重点实验室	3	8	2.0	2.0
4	罗红梅	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所中草药物质基础与资源利用教育部重点实验室	11	164	3.0	11.0
5	张玉	青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物重点实验室	2	13	2.0	2.0