海南五指山猪TLR2基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘海隆 张艳 林哲敏 谭树义 黄丽丽
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: 海南 五指山猪 TLR2基因 克隆 生物信息学分析 序列分析
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 37-40,44,286-287
• 页数: 1页
• 分类号: S828.8+9|Q78
• 语种: 中文

摘要

为了探讨海南五指山猪TLR2基因的分子结构特征及相关遗传变异,为研究TLR2基因遗传变异与免疫疾病的关系打下基础,试验采用PCR技术对该基因组序列进行克隆、测序及相关生物信息学分析.结果表明:获得2 649 bp的五指山猪TLR2基因的DNA序列,其基因编码区全长2 358 bp,编码785个氨基酸;与GenBank中发布的普通猪TLR2基因序列相比,共发现9处突变,其中在编码区序列存在2处突变,属于有义突变;与普通猪、马、牛、绵羊、人、黑猩猩、猕猴、犬、小鼠、鸡、斑马鱼的氨基酸序列的一致性分别为99.7％、82.1％、81.4％、80.6％、78.4％、78.4％、77.8％、77.3％、68.2％、50.7％、40.4％;五指山猪TLR2编码的蛋白主要位于质膜,属于分泌性蛋白、亲水性蛋白和跨膜蛋白,有信号肽和5个糖基化修饰位点,存在较多的丝氨酸(Ser)和苏氨酸(Thr)磷酸化位点;不同物种TLR2基因在进化过程中具有较高的保守性.说明TLR2基因可作为今后研究海南五指山猪免疫疾病的重要指标之一.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谭树义		35	96	3.0	9.0
2	张艳		42	74	3.0	5.0
3	刘海隆		54	93	5.0	7.0
4	林哲敏		57	89	4.0	6.0
5	黄丽丽		28	68	5.0	8.0