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摘要:
[目的]克隆滇龙胆香叶醇10-羟化酶基因GrG10H(geraniol 10-hydroxylase),分析其生物信息学特征、基因结构、蛋白表达和组织表达情况,为龙胆苦苷生物合成途径解析提供理论依据.[方法]通过RT-PCR及基因克隆方法,从滇龙胆总RNA中克隆得到基因GrG10H及其基因组序列;使用生物信息学方法分析其DNA序列及其编码蛋白特性,使用Clustal X2.1软件对GrG10H蛋白质及其同源序列做序列比对,使用MEGA7.0软件进行系统发育树构建;利用定量PCR技术分析GrG10H基因在滇龙胆根茎叶中的表达水平.[结果]使用RT-PCR方法从滇龙胆叶片中克隆得GrG10H基因全长为1834 bp,包含2外显子和1内含子,ORF1548 bp,将序列提交至GenBank,得到序列号KJ418410.生物信息学分析表明,该基因编码515个氨基酸,分子量为57.74 kD,理论等电点为9.02;该蛋白属于细胞色素P450超家族成员,定位于内质网,其N端含一跨膜螺旋(21 ~43),其中1~20氨基酸残基位于膜内,44~515位于膜外.该蛋白无信号肽,为亲水稳定蛋白,主要由无规则卷曲(44.85%)和α-螺旋(40.58%)构成.GrG10H蛋白与川西獐牙菜SmG10H蛋白具有较高的相似性(87%),且亲缘关系最近.原核表达结果表明,GrG10H基因在大肠杆菌中表达的重组蛋白相对分子质量约为83.74 kD(含GST标签26.00 kD),与预期蛋白大小一致.组织特异性表达分析结果表明GrG10H基因主要在叶中表达.[结论]克隆到滇龙胆GrG10H基因,并成功在大肠杆菌中表达,推测其在主要叶片中起作用.
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文献信息
篇名 滇龙胆香叶醇10-羟化酶基因的克隆与表达分析
来源期刊 西南农业学报 学科 生物学
关键词 滇龙胆 香叶醇10-羟化酶 基因克隆 表达分析
年,卷(期) 2017,(7) 所属期刊栏目 作物遗传育种·种质资源
研究方向 页码范围 1499-1506
页数 8页 分类号 Q786
字数 5966字 语种 中文
DOI 10.16213/j.cnki.scjas.2017.7.006
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王元忠 云南省农业科学院药用植物研究所 162 905 14.0 19.0
2 王家金 云南省农业科学院药用植物研究所 30 73 5.0 6.0
3 张晓东 玉溪师范学院资源环境学院 31 71 5.0 7.0
4 李彩霞 玉溪师范学院资源环境学院 19 43 4.0 6.0
5 刘倩倩 玉溪师范学院资源环境学院 2 1 1.0 1.0
6 李爽 玉溪师范学院资源环境学院 1 0 0.0 0.0
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滇龙胆
香叶醇10-羟化酶
基因克隆
表达分析
研究起点
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期刊影响力
西南农业学报
月刊
1001-4829
51-1213/S
大16开
成都市外东沙河大桥侧
62-152
1982
chi
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