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滇龙胆香叶醇10-羟化酶基因的克隆与表达分析
滇龙胆香叶醇10-羟化酶基因的克隆与表达分析
作者:
刘倩倩
张晓东
李彩霞
李爽
王元忠
王家金
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
滇龙胆
香叶醇10-羟化酶
基因克隆
表达分析
摘要:
[目的]克隆滇龙胆香叶醇10-羟化酶基因GrG10H(geraniol 10-hydroxylase),分析其生物信息学特征、基因结构、蛋白表达和组织表达情况,为龙胆苦苷生物合成途径解析提供理论依据.[方法]通过RT-PCR及基因克隆方法,从滇龙胆总RNA中克隆得到基因GrG10H及其基因组序列;使用生物信息学方法分析其DNA序列及其编码蛋白特性,使用Clustal X2.1软件对GrG10H蛋白质及其同源序列做序列比对,使用MEGA7.0软件进行系统发育树构建;利用定量PCR技术分析GrG10H基因在滇龙胆根茎叶中的表达水平.[结果]使用RT-PCR方法从滇龙胆叶片中克隆得GrG10H基因全长为1834 bp,包含2外显子和1内含子,ORF1548 bp,将序列提交至GenBank,得到序列号KJ418410.生物信息学分析表明,该基因编码515个氨基酸,分子量为57.74 kD,理论等电点为9.02;该蛋白属于细胞色素P450超家族成员,定位于内质网,其N端含一跨膜螺旋(21 ~43),其中1~20氨基酸残基位于膜内,44~515位于膜外.该蛋白无信号肽,为亲水稳定蛋白,主要由无规则卷曲(44.85%)和α-螺旋(40.58%)构成.GrG10H蛋白与川西獐牙菜SmG10H蛋白具有较高的相似性(87%),且亲缘关系最近.原核表达结果表明,GrG10H基因在大肠杆菌中表达的重组蛋白相对分子质量约为83.74 kD(含GST标签26.00 kD),与预期蛋白大小一致.组织特异性表达分析结果表明GrG10H基因主要在叶中表达.[结论]克隆到滇龙胆GrG10H基因,并成功在大肠杆菌中表达,推测其在主要叶片中起作用.
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文献信息
篇名
滇龙胆香叶醇10-羟化酶基因的克隆与表达分析
来源期刊
西南农业学报
学科
生物学
关键词
滇龙胆
香叶醇10-羟化酶
基因克隆
表达分析
年,卷(期)
2017,(7)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源
研究方向
页码范围
1499-1506
页数
8页
分类号
Q786
字数
5966字
语种
中文
DOI
10.16213/j.cnki.scjas.2017.7.006
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王元忠
云南省农业科学院药用植物研究所
162
905
14.0
19.0
2
王家金
云南省农业科学院药用植物研究所
30
73
5.0
6.0
3
张晓东
玉溪师范学院资源环境学院
31
71
5.0
7.0
4
李彩霞
玉溪师范学院资源环境学院
19
43
4.0
6.0
5
刘倩倩
玉溪师范学院资源环境学院
2
1
1.0
1.0
6
李爽
玉溪师范学院资源环境学院
1
0
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0.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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共引文献
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香叶醇10-羟化酶
基因克隆
表达分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
西南农业学报
主办单位:
四川
云南
贵州
广西
西藏及重庆省(区
市)农科院
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-4829
CN:
51-1213/S
开本:
大16开
出版地:
成都市外东沙河大桥侧
邮发代号:
62-152
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
8472
总下载数(次)
8
总被引数(次)
71178
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