利用生物信息学发现基因HADH与SRC为卵巢癌潜在治疗靶基因

• 作者: 李红梅 郭世民
• 来源期刊: 临床医药文献电子杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 卵巢癌 生物信息学 生存预后 靶基因
• 年，卷（期）: 2017,（97）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 19011-19012,19028
• 页数: 3页
• 分类号: R737.31
• 字数: 2087字
• 语种: 中文

摘要

本研究的目的是筛选卵巢癌的潜在靶基因,运用生物信息学探索卵巢癌发病机制.方法是从公共基因芯片数据库(GEO)收集并整理有关卵巢癌表达的数据,利用R语言筛选癌和癌旁表达差异基因,对差异基因进行层次聚类分析,用Cytoscape软件进行基因本体(GO)分析和蛋白相互作用网络(PPI)构建.结果表明,196个基因在卵巢癌中差异表达,其中149个上调,47个下调;通过共表达网络积分分析识别出5个卵巢癌关键基因.筛选得到ALDH6A1、HADH、FYN、SRC、TNF 5个与卵巢癌相关的基因.196个差异表达基因本体论富集分析发现B细胞增殖调节、细胞生长因子调节、化学致癌作用等与卵巢癌的发病有关.通过Kaplan Meier Plotter进行生存预后的分析.最终筛选到2个卵巢癌关键基因:HADH、SRC可能是卵巢癌潜在的治疗靶点.利用生物信息学方法能有效筛选目标基因,并可为进一步实验验证提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李红梅	青岛大学医学院	29	81	5.0	7.0
2	郭世民	青岛大学医学院	2	3	1.0	1.0