基于16S rRNA序列对4种扇贝4个群体亲缘关系分析

• 作者: 丁君 常亚青 曾令坤 李祯 田莹 相明玥
• 来源期刊: 中国渔业质量与标准
• 学科: 农学
• 关键词: 扇贝 16S rRNA 亲缘关系 遗传距离 系统发育树 PCR扩增
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 页码范围: 68-74
• 页数: 7页
• 分类号: S93
• 字数: 4527字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1833.2018.03.009

摘要

大连市场上出现一种与栉孔扇贝(Chlamys farreri)形态结构相似的扇贝,被人们俗称为“俄罗斯栉孔扇贝”.为了探究其与3种常见扇贝的亲缘关系,本研究利用16S rRNA基因序列,将“俄罗斯栉孔扇贝”分别与中国地区的栉孔扇贝(Chlamys farreri、海湾扇贝(Argopecten irradians)、虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)以及美国大西洋地区的海湾扇贝(Argopecten irradians)和日本地区的虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)等不同地区群体的扇贝进行遗传学对比分析,并结合GenBank中其他双壳贝类16S rRNA序列分析碱基组成,计算种间遗传距离,构建系统发育树,明确该扇贝的分类地位.结果显示:4种碱基(A、T、G、C)各自的含量较为接近,且这4种扇贝的基因片段中,A+T的含量均高于G+C的含量,这与其他贝类16S rRNA基因片段的研究结果相一致.16S rRNA(长牡蛎为外群)的双壳贝类系统发育树分析显示,与该扇贝亲缘关系由近及远分别是虾夷扇贝、栉孔扇贝、赭类栉孔扇贝、华贵栉孔扇贝、海扇贝、海湾扇贝和长牡蛎.该扇贝与虾夷扇贝遗传距离最近(0.073),且其与栉孔扇贝遗传距离已达到种间差异水平.序列对比结果说明该“俄罗斯栉孔扇贝”是岛扇贝(Chlamys islandica).本研究将为在分子水平上了解不同地区的4种扇贝群体遗传背景提供信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	常亚青	农业部北方海水增养殖重点实验室大连海洋大学水产与生命学院	5	39	3.0	5.0
2	相明玥	农业部北方海水增养殖重点实验室大连海洋大学水产与生命学院	1	2	1.0	1.0
3	曾令坤	农业部北方海水增养殖重点实验室大连海洋大学水产与生命学院	1	2	1.0	1.0
4	李祯	农业部北方海水增养殖重点实验室大连海洋大学水产与生命学院	1	2	1.0	1.0
5	田莹	农业部北方海水增养殖重点实验室大连海洋大学水产与生命学院	1	2	1.0	1.0