黄瓜CsGASA4基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 于思琦 刘东 周秀艳 秦智伟 辛明
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜 CsGASA4基因 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 19-26
• 页数: 8页
• 分类号: S642.2
• 字数: 4232字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-9369.2018.07.003

摘要

选取霜霉病与棒孢叶斑病两种病害胁迫后,在抗病品种中上调表达、感病品种中下调表达的基因克隆.通过生物信息学分析,初步开展该基因编码蛋白理化性质分析、亲疏水性预测、亚细胞定位预测、蛋白质结构预测.结果表明,该基因编码区全长315 bp,编码104个氨基酸,编码蛋白属于GASA super-family,具有跨膜结构,存在明显信号肽.系统进化树显示与大马士革玫瑰亲缘关系最近,同源性最高.根据其编码蛋白将该基因命名为CsGASA 4,亚细胞定位于分泌系统囊泡中.研究为进一步探究该基因功能及挖掘黄瓜双抗基因奠定基础.