西施舌浮游幼虫cDNA文库构建及EST序列初步分析

• 作者: 孟学平 郭永明
• 来源期刊: 内蒙古民族大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 西施舌 浮游幼虫 cDNA文库 表达序列标签(EST)
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 生物学研究
• 页码范围: 49-55
• 页数: 7页
• 分类号: Q756
• 字数: 5218字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14045/j.cnki.15-1220.2018.01.011

摘要

为了研究西施舌浮游幼虫阶段的基因表达规律,构建了7日龄浮游幼虫的cDNA文库,对文库质量的分析结果表明,cDNA文库的库容量为2.3×105,重组率达95％,平均插入片段长度1.0 kb左右.挑取cDNA克隆进行5′端测序,总共进行了304个成功反应,其中294条ESTs长度为100～699 bp,平均长度为492 bp.初步拼接得到158个单基因簇(Unigene),其中包括19个重叠群(Contigs),139个单拷贝ESTs(Singletons).与GenBank非冗余蛋白库进行Blastx比对,发现71.4％ESTs在GenBank中有同源序列(blast score≥50 bits),无明显相似性EST序列占28.6％,提示此文库有许多未知的基因.丰度最高的是组蛋白cDNA(包括组蛋白H1和组蛋白H2A),占总EST序列的39.5％.在116个ESTs中获得组蛋白H1和H2A基因的2个开放阅读框,分别为561和375个碱基,编码186,124个氨基酸残基的肽段.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孟学平	淮海工学院生命与水产学院	46	339	11.0	15.0
2	郭永明	集宁师范学院生物系	6	8	2.0	2.0