运用实时定量PCR和16S rDNA测序法分析女性阴道菌群的结果比较

• 作者: 张宁 朱丽红 江滟 秦金红 韩阳 骆菲
• 来源期刊: 上海交通大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 阴道菌群 实时定量PCR 16S rDNA高通量测序
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 71-75
• 页数: 5页
• 分类号: R446.5
• 字数: 4191字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-8115.2018.01.013

摘要

目的·比较实时定量PCR (qPCR)法与16S rDNA测序法分析女性阴道菌群类型的结果.方法·选取45岁以下育龄期健康女性49名,采集阴道上1/3处分泌物,经提取阴道标本全基因组DNA后,分别运用16S rDNA VlV2域测序和基于22种常见阴道细菌设计的引物进行qPCR分析各样本菌群类型,比较2种检测结果的异同.结果·参考依据优势菌类型的阴道菌群分类标准,基于qPCR方法分析结果为Ⅰ型(卷曲乳杆菌为优势菌)9例,Ⅲ型(惰性乳杆菌为优势菌)24例,Ⅳ型(无乳杆菌为优势菌)12例,V型(詹氏乳杆菌为优势菌)为2例.基于16S rDNA VlV2域进行测序分析的结果为Ⅰ型13例,Ⅱ型(格氏乳杆菌为优势菌)1例,Ⅲ型23例,Ⅳ型8例,V型2例.2种方法对阴道菌群分型一致的为38例,一致率为77.6％.结论·2种方法分析得到的阴道菌群分类结果有差异;若采用qPCR对阴道菌群进行分类,还需考虑相关的技术因素对结果的影响.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张宁	贵州医科大学贵州省普通高校病原生物学特色重点实验室	29	96	6.0	9.0
3	秦金红	上海交通大学基础医学院免疫学与微生物学系	20	35	3.0	5.0
4	韩阳	贵州医科大学贵州省普通高校病原生物学特色重点实验室	4	2	1.0	1.0
6	骆菲		4	4	1.0	1.0
7	朱丽红	复旦大学附属华东医院妇科	9	52	4.0	7.0