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运用实时定量PCR和16S rDNA测序法分析女性阴道菌群的结果比较
运用实时定量PCR和16S rDNA测序法分析女性阴道菌群的结果比较
作者:
张宁
朱丽红
江滟
秦金红
韩阳
骆菲
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
阴道菌群
实时定量PCR
16S rDNA高通量测序
摘要:
目的·比较实时定量PCR (qPCR)法与16S rDNA测序法分析女性阴道菌群类型的结果.方法·选取45岁以下育龄期健康女性49名,采集阴道上1/3处分泌物,经提取阴道标本全基因组DNA后,分别运用16S rDNA VlV2域测序和基于22种常见阴道细菌设计的引物进行qPCR分析各样本菌群类型,比较2种检测结果的异同.结果·参考依据优势菌类型的阴道菌群分类标准,基于qPCR方法分析结果为Ⅰ型(卷曲乳杆菌为优势菌)9例,Ⅲ型(惰性乳杆菌为优势菌)24例,Ⅳ型(无乳杆菌为优势菌)12例,V型(詹氏乳杆菌为优势菌)为2例.基于16S rDNA VlV2域进行测序分析的结果为Ⅰ型13例,Ⅱ型(格氏乳杆菌为优势菌)1例,Ⅲ型23例,Ⅳ型8例,V型2例.2种方法对阴道菌群分型一致的为38例,一致率为77.6%.结论·2种方法分析得到的阴道菌群分类结果有差异;若采用qPCR对阴道菌群进行分类,还需考虑相关的技术因素对结果的影响.
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文献信息
篇名
运用实时定量PCR和16S rDNA测序法分析女性阴道菌群的结果比较
来源期刊
上海交通大学学报(医学版)
学科
医学
关键词
阴道菌群
实时定量PCR
16S rDNA高通量测序
年,卷(期)
2018,(1)
所属期刊栏目
临床研究
研究方向
页码范围
71-75
页数
5页
分类号
R446.5
字数
4191字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-8115.2018.01.013
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
张宁
贵州医科大学贵州省普通高校病原生物学特色重点实验室
29
96
6.0
9.0
3
秦金红
上海交通大学基础医学院免疫学与微生物学系
20
35
3.0
5.0
4
韩阳
贵州医科大学贵州省普通高校病原生物学特色重点实验室
4
2
1.0
1.0
6
骆菲
4
4
1.0
1.0
7
朱丽红
复旦大学附属华东医院妇科
9
52
4.0
7.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(0)
共引文献
(0)
参考文献
(13)
节点文献
引证文献
(1)
同被引文献
(5)
二级引证文献
(0)
2006(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
2010(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
2011(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
2012(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
2015(5)
参考文献(5)
二级参考文献(0)
2016(3)
参考文献(3)
二级参考文献(0)
2017(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
2018(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
2020(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
阴道菌群
实时定量PCR
16S rDNA高通量测序
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
上海交通大学学报(医学版)
主办单位:
上海交通大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-8115
CN:
31-2045/R
开本:
大16开
出版地:
上海市重庆南路280号
邮发代号:
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
7490
总下载数(次)
12
总被引数(次)
41931
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