版纳微型猪近交系KITLG基因克隆、组织表达及功能特性分析

• 作者: 张霞 查星琴 潘伟荣 王淑燕 王配 霍金龙
• 来源期刊: 云南农业大学学报（自然科学）
• 学科: 农学
• 关键词: 干细胞因子 版纳微型猪近交系 组织表达 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 255-261
• 页数: 7页
• 分类号: S828.2
• 字数: 3631字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12101/j.issn.1004-390X(n).201704035

摘要

[目的]研究KITLG基因在猪生殖细胞发育过程中的作用.[方法]从GenBank下载猪KITLG序列作为参考序列,设计特异引物从版纳微型猪近交系(BMI)附睾组织中扩增KITLG基因完全编码序列及部分侧翼序列;应用半定量PCR技术检测BMI 10个重要组织的KITLG mRNA转录表达水平,并对KITLG翻译的蛋白质序列进行多种功能生物信息学分析,预测KITLG蛋白质的功能,最后构建KITLG的多物种氨基酸系统进化树.[结果]扩增得到BMI KITLG编码区序列长825 bp,编码274个氨基酸,序列已提交GenBank,基因登录号KU705624,对应的氨基酸登录号AOC89042.多组织相对半定量表达分析表明:KITLG基因在附睾、心、脾、肺、肾、胃中高表达,在大脑、肝、小肠和睾丸中低表达.功能生物信息学分析表明:KITLG存在1个保守结构域SCF,有1个跨膜螺旋结构,存在N端信号肽序列,N末端和C末端均亲水,二级结构以α螺旋为主,有5类功能活性位点.系统进化分析表明:KITLG在进化中高度保守,且与牛、羊的亲缘关系最近.[结论]研究结果为探索BMI KITLG基因在生殖细胞发育过程中的作用及功能奠定基础.