观赏海棠SSR-PCR体系优化及引物筛选应用

• 作者: 倪州献 周婷 张往祥 徐立安 黄彬
• 来源期刊: 南京林业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 观赏海棠 SSR-PCR 体系优化 引物筛选
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 专题报道(Ⅱ)
• 页码范围: 51-57
• 页数: 7页
• 分类号: S722
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.201801006

摘要

[目的]为探究适用于观赏海棠SSR反应分子标记研究的最佳PCR反应条件,采用正交设计法对观赏海棠SSR-PCR体系进行优化,并利用优化体系筛选适于观赏海棠的多态性SSR引物.[方法]以6个二倍体观赏海棠DNA模板为材料,采用L16(45)正交试验对DNA模板浓度、Taq酶浓度、引物浓度、Mg2+浓度和dNTP浓度进行优化实验,确立了观赏海棠SSR-PCR最佳反应体系.[结果]得出15 μL优化体系各成分为:DNA模板5 mg/L、Taq酶1.25 U、引物0.3μmol/L、Mg2+2 mmol/L、dNTP 0.25 mmol/L、1 ×Buffer1.5 μL.利用优化体系在73对苹果属SSR引物中筛选出15对条带清晰、多态性丰富、重复性好的SSR引物并确定各引物的退火温度,其多态信息含量均大于0.25.[结论]正交试验结果达到优化目的,利用优化体系筛选的15对多态性引物可直接应用于观赏海棠SSR分子标记实验中,为观赏海棠品种鉴定、分类以及遗传育种等研究提供了有效工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张往祥	南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院	5	36	4.0	5.0
2	周婷	南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院	2	10	1.0	2.0
3	黄彬	南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院	2	5	1.0	2.0
4	徐立安	南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院	2	5	1.0	2.0
5	倪州献	南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院	1	1	1.0	1.0