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大黄鱼免疫球蛋白M重链基因全长cDNA序列的克隆与表达
大黄鱼免疫球蛋白M重链基因全长cDNA序列的克隆与表达
作者:
刘卫刚
张子平
王艺磊
谢芳靖
邹鹏飞
韩坤煌
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
大黄鱼
IgMH
副溶血弧菌
基因表达
定量PCR
摘要:
从本实验室自建的大黄鱼表达标签数据库中获取了大黄鱼免疫球蛋白M重链(LcIgMH)基因片段,并以此设计SMART-RACE引物,最终得到1917 bp的全长cDNA序列.经分析发现其含6 bp的5'非编码区(5'UTR)、176 bp的3'UTR以及1738 bp的开放阅读框(ORF);预测的ORF共编码584个氨基酸,蛋白质分子量为65.2 ku,等电点为5.84;利用SingalP 4.1 Server发现其5'端含有信号肽(1-19 aa);BlastP Server的结果显示,其与红笛鲷的IgMH序列一致性最高,达到64%;利用IMGT/Domain Gap Align 进行重链可变区与恒定区预测,发现含有1个重链可变区与4个重链恒定区,同时,预测还发现可变区含有典型的3个高变区与4个骨架区结构.实时荧光定量PCR结果显示该基因在头肾与脾脏中大量表达,并显著高于其他各组织,同时雌雄鱼LcIgMH在各组织中表达量均无显著性差异,表明LcIgMH表达与性别无关.注射副溶血弧菌进行感染4d后,脾脏内LcIgMH表达量最高,并且与对照组之间存在显著性差异(P<0.05),但感染后第8天的表达水平已与对照组无显著性差异(P>0.05),显示LcIgMH与大黄鱼的免疫应答反应相关.
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文献信息
篇名
大黄鱼免疫球蛋白M重链基因全长cDNA序列的克隆与表达
来源期刊
集美大学学报(自然科学版)
学科
农学
关键词
大黄鱼
IgMH
副溶血弧菌
基因表达
定量PCR
年,卷(期)
2018,(6)
所属期刊栏目
水产、食品与生物技术
研究方向
页码范围
407-415
页数
9页
分类号
Q78|S917.4
字数
4689字
语种
中文
DOI
10.19715/j.jmuzr.2018.06.02
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王艺磊
集美大学水产学院
80
1300
17.0
35.0
3
谢芳靖
集美大学水产学院
9
124
6.0
9.0
4
韩坤煌
集美大学水产学院
10
37
4.0
6.0
8
张子平
12
11
2.0
2.0
10
邹鹏飞
集美大学水产学院
2
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2.0
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刘卫刚
集美大学水产学院
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传播情况
被引次数趋势
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引文网络
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共引文献
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同被引文献
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副溶血弧菌
基因表达
定量PCR
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研究来源
研究分支
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期刊影响力
集美大学学报(自然科学版)
主办单位:
集美大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1007-7405
CN:
35-1186/N
开本:
大16开
出版地:
福建厦门集美银江路185号
邮发代号:
创刊时间:
1996
语种:
chi
出版文献量(篇)
1788
总下载数(次)
5
总被引数(次)
8910
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集美大学学报(自然科学版)2018年第5期
集美大学学报(自然科学版)2018年第4期
集美大学学报(自然科学版)2018年第3期
集美大学学报(自然科学版)2018年第2期
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