大豆NIP类水孔蛋白基因的鉴定及表达特性分析

• 作者: 冯志娟 刘娜 吴伟 张古文 徐盛春 胡齐赞 龚亚明
• 来源期刊: 浙江农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 NIP 水孔蛋白 全基因组鉴定 组织表达 干旱应答
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 作物科学
• 页码范围: 1101-1109
• 页数: 9页
• 分类号: S643.1
• 字数: 4837字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-1524.2018.07.01

摘要

NIPs(nodulin 26-like intrinsic proteins)是类根瘤菌26膜内在蛋白,属于水孔蛋白的一个亚类,在植物逆境胁迫应答过程中发挥重要作用.利用大豆基因组数据库,在全基因组水平共鉴定得到13个GmNIPs.染色体定位分析显示,这些GmNIPs基因分布在大豆11条染色体上.理化性质分析显示,GmNIPs蛋白氨基酸数目为261～296,蛋白分子量为27～32 ku,蛋白等电点为6～10.蛋白多序列比对分析发现,所有GmNIPs均含有水通道蛋白的典型结构,6个保守的跨膜螺旋(TM1-TM6)和2个保守的氨基酸元件NPA盒(Asp-Pro-Ala box).进化树分析发现,大豆GmNIPs与拟南芥和水稻NIPs分类完全一致.基因结构分析显示,所有GmNIPs基因均由5个外显子和4个内含子组成.启动子分析表明,多数GmNIPs基因的上游启动子区含有逆境和激素应答元件.组织表达分析发现,5个GmNIPs的基因表达量相对较高.进一步,利用荧光定量PCR对GmNIP1;5的干旱胁迫表达特性进行了分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴伟		64	709	13.0	25.0
2	龚亚明	浙江省农业科学院蔬菜研究所	55	212	8.0	11.0
3	胡齐赞	浙江省农业科学院蔬菜研究所	59	199	7.0	10.0
4	张古文	浙江省农业科学院蔬菜研究所	34	133	6.0	10.0
5	徐盛春	浙江省农业科学院蔬菜研究所	28	103	5.0	8.0
6	刘娜	浙江省农业科学院蔬菜研究所	13	24	2.0	4.0
7	冯志娟	浙江省农业科学院蔬菜研究所	12	22	2.0	4.0