小麦Wcor15基因上游调控区克隆及生物信息学分析

• 作者: 佘茂云 刘方方 殷桂香
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 小麦 Wcor15基因 启动子 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 基因组学及功能基因
• 页码范围: 1033-1039
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13271/j.mpb.016.001033

摘要

为了克隆小麦Wcor15基因启动子序列和预测可能的表达调控途径,试验设计特异引物采用PCR方法从小麦基因组DNA中直接进行扩增并测序,用Neural Network Promoter Prediction、Promoter SCAN、Promoter 2.0和MethPrimer软件对启动子结构进行分析,PLACE在线分析预测可能的顺式作用元件.结果表明:克隆获得了一段长度为2 046 bp的Wcor15基因上游调控区序列,软件预测显示该区域含有4个可能的启动子,除了具有一般启动子的CAAT-box、TATA-box典型结构外,还含有CBFHV、ACGTATERD1、ABRELATERD1、ARR1AT、CANBNNAPA应答非生物胁迫、激素等重要作用元件.序列比对发现小麦Wcor15启动子与拟南芥cor15a、大麦cor14b的一致性分别为36.92％和40.29％.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	殷桂香		2	6	1.0	2.0
2	佘茂云		2	6	1.0	2.0
3	刘方方		3	0	0.0	0.0