栽培种西番莲完全型SSR的高通量鉴定及标记开发

• 作者: 刘洁云 吴艳艳 李小泉 牟海飞 田青兰 黄伟华 黄永才
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 西番莲 完全型SSR 高通量 分子标记
• 年，卷（期）: 2018,（20）
• 所属期刊栏目: 标记辅助育种
• 页码范围: 6738-6743
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13271/j.mpb.016.006738

摘要

SSR标记具有多态性高、重复性好、共显性等特点,易被用来开发高效简单实用的分子标记.为了丰富栽培种西番莲分子标记的种类和数量,本研究利用生物信息学方法对栽培种西番莲基因组中的完全型SSR进行高通量鉴定,获得13 104个完全型SSR.SSR核心序列结构主要为2～4个碱基,数量最多的为TA、AT、TC和AG,重复次数最高达到20次.利用生物信息学软件开发出12 934对SSR标记,并选取了其中20对标记在西番莲MTX与WJ10中进行了扩增特异性评估,结果显示多态率达60％.西番莲栽培种SSR标记的大量开发为西番莲种质资源的高效利用、品种的遗传改良及分子育种提供了技术支持.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李小泉		20	83	6.0	8.0
2	牟海飞		19	109	6.0	10.0
3	黄伟华		9	8	2.0	2.0
4	田青兰		5	3	1.0	1.0
5	黄永才		5	3	1.0	1.0
6	吴艳艳		10	7	2.0	2.0
7	刘洁云		6	0	0.0	0.0