桉树焦枯病菌MDR基因生物信息学分析及功能解析

• 作者: 丁奕 冯丽贞 刘宏毅 叶小真 张晓阳 张清华 陆芝
• 来源期刊: 《福建农林大学学报（自然科学版）》
• 关键词: 桉树焦枯病菌 MDR基因 生物信息学 表达分析
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 88-96
• 页数: 9页
• 分类号: S763.15
• 语种: 中文
• DOI: 10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2019.01.015

摘要

通过生物信息软件及qPCR对桉树焦枯病菌MDR蛋白的序列特征、蛋白结构、理化性质及MDR基因在不同条件下的表达情况进行分析.结果表明,MDR转运蛋白均由α-折叠、无规则卷曲、β-转角,所占百分比α-折叠>β-转角>无规则卷曲.三级与二级结构预测均显示桉树焦枯病菌MDR具有典型的MDR蛋白结构,说明该蛋白家族的进化比较保守;CpABCB10基因参与调控分生孢子稳定性和萌发,CpABCB4和CpABCB9基因参与调控金属离子的转运,CpABCB7和CpABCB8基因参与调控桉树焦枯病菌的抗药机制.此外,CpABCB7基因还能参与调控桉树焦枯病菌的整个致病过程.