江苏省2013—2014年3株柯萨奇病毒B组5型流行株全基因组序列分析

• 作者: 卞莲莲 姚昕 孙世洋 杨晓明 梁争论 毛群颖 高帆
• 来源期刊: 微生物学免疫学进展
• 学科: 医学
• 关键词: 柯萨奇病毒B组5型 基因组 重组 分析
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 9-16
• 页数: 8页
• 分类号: R373.2+3
• 字数: 4327字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13309/j.cnki.pmi.2019.02.002

摘要

目的 分析引起江苏省疱疹性咽峡炎的柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5,CV-B5)毒株基因组特征.方法 对江苏省2013—2014年3例疱疹性咽峡炎患儿临床标本进行病原分离,获得3株CV-B5毒株,进行全基因组序列测定,与GenBank中世界各地不同年份CV-B5流行株序列进行比对分析,使用Mega 5.2软件构建系统进化树,并应用Simplot软件进行重组分析.结果 获得3株CV-B5毒株,分别命名为417/JS/CHN/2013、492/JS/CHN/2013和759/JS/CHN/2014,均属于GI.D3亚型,且在位点5224～5696 bp(以Faulkner为参考株)与2008年北京市的CV-B3流行株(GQ141875)发生重组,在位点5696 bp之后与2009年昆明市的CV-B3流行株(JX843810)发生重组.结论 CV-B5在婴幼儿人群中的感染可能存在严重危害,应加强对CV-B5的分子流行病学研究,监测可能发生的重组.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨晓明		32	129	6.0	8.0
2	毛群颖	中国食品药品检定研究院肝炎病毒疫苗室	26	61	4.0	7.0
3	姚昕	中国食品药品检定研究院肝炎病毒疫苗室	21	30	3.0	4.0
4	高帆	中国食品药品检定研究院肝炎病毒疫苗室	19	29	3.0	4.0
5	卞莲莲	中国食品药品检定研究院肝炎病毒疫苗室	19	47	3.0	6.0
7	孙世洋	中国食品药品检定研究院肝炎病毒疫苗室	3	2	1.0	1.0