杭州地区催吐型蜡样芽孢杆菌基因组特征与毒力因子分析

• 作者: 俞骅 刘小东 刘涛 张蔚 楼秀芹 汪皓秋 程实 郑之北 郑伟 陈琦
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 关键词: 蜡样芽孢杆菌 基因组测序 毒力因子 基因组分析
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 细菌学
• 页码范围: 572-577
• 页数: 6页
• 字数: 3686字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2019.08.002

摘要

目的 了解杭州地区食品分离催吐型蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)菌株毒力因子携带情况和基因组基本特征,分析催吐型蜡样芽孢杆菌的致病性.方法 采用实时荧光PCR方法检测132株2015—2017年分离自食品的蜡样芽孢杆菌呕吐毒素合成基因簇(ces基因簇),并使用Illumina MiSeq测序平台对ces基因簇阳性菌株进行基因组测序.随后,进行基因组组装、注释、毒力因子、比较基因组学及进化分析.结果 12株(9.09％)菌株ces基因阳性.该12株蜡样芽孢杆菌基因组组装大小从5.35～5.75 Mb,GC含量从35.25～35.43 mol％.12株催吐型蜡样芽孢杆菌均携带完整呕吐毒素ces基因簇序列和非溶血性肠毒素NHE基因簇(nheA、nheB、nheC)、溶血素Ⅲ(hlyⅢ)等毒力因子.本地分离的12株催吐型蜡样芽孢杆菌及参考菌株NC7401(登录号AP007209)间平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)超过99.35％.系统发育分析表明该12株测序菌株与催吐型蜡样芽孢杆菌处于同一进化分支.结论 杭州地区食品来源的催吐型蜡样芽孢杆菌基因组序列与高产呕吐毒素的参考菌株NC7401高度近源.基因组分析发现许多致病性相关毒力因子.