1株3型鸭甲肝病毒的VP1和VP3基因的密码子使用偏性分析

• 作者: 任慧英 刘文华 张灿 殷茵 闫艳新
• 来源期刊: 青岛农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 3型鸭甲肝病毒 VP1基因 VP3基因 密码子偏性
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 动物科学·动物医学
• 页码范围: 45-50
• 页数: 6页
• 分类号: S852.65+9.6|S855.3
• 字数: 4181字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/J.ISSN.1674-148X.2019.01.009

摘要

为了解临床分离的1株3型鸭甲肝病毒的结构蛋白VP1和VP3基因的密码子使用特性,本文对该毒株的VP1和VP3基因与从NCBI下载的同源性较高的3型鸭甲肝病毒进行了密码子偏性分析.结果 表明,该毒株的VP1和VP3与所比对的5株3型鸭甲肝病毒VP1和VP3基因密码子使用模式基本一致,分别确定了12种和13种高频密码子,且偏爱以A或U结尾.通过6株3型鸭甲肝病毒的VP1和VP3基因的密码子偏性比较和聚类分析发现,其中4株分类地位相近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘文华	青岛农业大学动物医学院	80	297	9.0	13.0
2	任慧英	青岛农业大学动物医学院	116	629	14.0	20.0
3	张灿	青岛农业大学动物医学院	46	118	6.0	9.0
4	闫艳新	青岛农业大学动物医学院	4	6	1.0	2.0
5	殷茵	青岛农业大学动物医学院	2	0	0.0	0.0