84K杨4CL3/4CL5基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 孙晓莎 曲冠证 王遂 赵曦阳
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 农学
• 关键词: 84K杨 4CL基因 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 547-556
• 页数: 10页
• 分类号: S792.119
• 字数: 5065字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2019.04.009

摘要

木质素是木材的重要组成成分,主要起机械支持、水分运输及防御病虫害等作用.4CL酶是控制木质素合成途径中的关键酶之一.利用PCR技术从84K杨幼叶cDNA中克隆得到Pag4CL3/4CL5基因,GenBank登录号分别为MK183033(Pag4CL3)及MK183034(Pag4CL5).利用生物信息学软件,对这两个基因的功能和特征进行分析.结果 发现84K杨中4CL3/4CL5蛋白与毛果杨中4CL3/4CL5蛋白相似度高达97％;此外,均含有SSGTTGLP-KGV和GEICIRG两个保守基序;亚细胞定位预测显示Pag4CL3/4CL5蛋白主要定位在内质网中,推测可能是一种膜蛋白;蛋白的亲水性预测Pag4CL3/4CL5均为亲水性蛋白.通过qRT-PCR分析Pag4CL3/4CL5在不同组织部位中的表达差异,结果发现Pag4CL3在叶及茎中表达量较高,在根和顶芽中表达量较低;Pag4CL5在叶及根中表达量较高,在茎和顶芽中表达量较低,两个同源基因表达具有组织部位的差异性.Pag4CL3和Pag4CL5可能在叶中共同行使功能,Pag4CL5主要在根中行使功能,Pag4CL3主要在茎中行使功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵曦阳		16	124	6.0	11.0
2	曲冠证		31	54	5.0	5.0
3	王遂		7	18	3.0	4.0
4	孙晓莎		1	0	0.0	0.0