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抗肿瘤化合物WX-132-18B与微管蛋白的分子对接研究
抗肿瘤化合物WX-132-18B与微管蛋白的分子对接研究
作者:
尹东锋
李倩
杨善鹏
王晓锋
鄂晓
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
抗肿瘤药物
微管蛋白
计算机辅助药物设计
分子对接
摘要:
目的 利用计算机辅助分子对接技术预测WX-132-18B与微管蛋白的合理结合方式,为其结构衍生化和设计新化合物提供理论支持.方法 通过软件DS3.0将微管蛋白与化合物2和3的复合晶体结构5OSK和6BR1相重叠,并将5OSK中的水分子W615嵌入到6BR1中形成新的蛋白结构6BR1',然后利用DS3.0中的分子对接模块CDOCKER将6BR1'和WX-132-18B进行对接.结果 WX-132-18B的最优构象与微管蛋白的结合能为-29.31 kcal/mol.其中,7-甲氧基-3,4-二氢喹(噁)啉-2(1H)-酮环中胺基上的氢原子作为氢键给体与水分子W615中的氧原子形成氢键,2-甲基喹唑啉环中1位的氮原子与水分子W675近端的氢原子形成氢键;同时,2-甲基喹唑啉环中的苯环与Alaβ314结构中的甲基形成σ-π相互作用.水分子W615和W675分别与氨基酸Asnα101、Thrα179和Valβ236、Cysβ239形成氢键,起到氢键传递的作用.结论 WX-132-18B通过水分子在微管蛋白α、β亚基之间与关键氨基酸形成相互作用.2-甲基喹唑啉啉环处于经典微管蛋白聚集抑制剂中3,4,5-三甲氧基苯基(A环)的结合位置;7-甲氧基-3,4-二氢喹(噁)啉-2(1H)-酮环中的甲氧基苯基处于经典微管蛋白聚集抑制剂中甲氧基芳基(B环)的位置,其中的哌嗪-2-酮环除起到构象限制的作用外,还增加了与微管蛋白α亚基的相互作用.
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文献信息
篇名
抗肿瘤化合物WX-132-18B与微管蛋白的分子对接研究
来源期刊
国际药学研究杂志
学科
医学
关键词
抗肿瘤药物
微管蛋白
计算机辅助药物设计
分子对接
年,卷(期)
2019,(5)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
371-374,381
页数
5页
分类号
R914.5
字数
2728字
语种
中文
DOI
10.13220/j.cnki.jipr.2019.05.007
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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G指数
1
尹东锋
新疆军区总医院药剂科
13
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王晓锋
新疆军区总医院药剂科
2
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杨善鹏
新疆军区总医院药剂科
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李倩
新疆军区总医院药剂科
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鄂晓
新疆军区总医院药剂科
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微管蛋白
计算机辅助药物设计
分子对接
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
国际药学研究杂志
主办单位:
军事医学科学院毒物药物研究所
中国药学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-0440
CN:
11-5619/R
开本:
大16开
出版地:
北京市海淀区太平路27号院六所
邮发代号:
82-135
创刊时间:
1958
语种:
chi
出版文献量(篇)
3220
总下载数(次)
11
总被引数(次)
23674
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