龙眼MSIL全基因组鉴定及表达分析

• 作者: 徐小萍 林玉玲 申序 许小琼 赖钟雄 陈晓慧
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 龙眼 体胚 MSIL 生物信息学分析 qPCR
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 热带植物基因组学与基因编辑专题
• 页码范围: 1938-1948
• 页数: 11页
• 分类号: S667.2|Q943.2
• 字数: 8375字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2019.10.006

摘要

MSIL(Muliticopy suppressor of IRA homolog1-Like)基因是WD重复蛋白的一个亚家族,在植物生长发育过程中发挥重要的作用.为了解龙眼MSIL(DlMSIL)基因家族的生物学功能,本研究基于基因组和转录组数据,采用生物信息学分析法对DlMSIL基因成员进行鉴定,并进行蛋白质结构及理化性质分析、系统发育进化树构建、启动子顺式作用元件分析、龙眼体胚阶段和不同组织器官表达情况以及GA3处理下的定量表达分析.结果表明:DlMSIL基因家族含有6个成员属于WD40和CAF1C_H4-bd超家族,可分为3类;DlMSIL蛋白编码393～551 aa,等电点为4.68～7.62,该家族成员均不属于分泌蛋白;基因家族成员的内含子数目在4～14之间;DlMSIL启动子序列包含大量非生物胁迫响应元件及MYB结合位点,推测DlMSIL基因家族可能参与多种非生物胁迫反应;DlMSIL可能参与不同胚胎的发育过程和不同组织器官的形态建成.GA3处理下的表达分析显示高浓度时,DlMSI1a与DlMSI1c的表达受到了一定的抑制,而DlMSI4a的表达量呈现先下降后上升再下降的趋势,推测DlMSIL可能参与激素响应途径.本研究表明,DlMSIL基因家族成员可能参与胚胎发育、激素信号通路以及非生物胁迫反应等多种生物学功能,体现了龙眼MSIL基因家族功能具有多样性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	林玉玲	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	148	560	10.0	16.0
3	徐小萍	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	25	20	3.0	3.0
4	陈晓慧	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	20	13	3.0	3.0
5	申序	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	4	0	0.0	0.0
6	许小琼	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	2	0	0.0	0.0