苹果锈果类病毒火焰海棠分离物全基因组克隆及序列分析

• 作者: 张富军 张振鲁 张蕊芬 王寻 由春香 郝玉金
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 火焰海棠 苹果锈果类病毒 序列分析 寄主特异性
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 1005-1012
• 页数: 8页
• 分类号: S661.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20190047

摘要

[目的]检测从山东青岛采集的有“花脸”症状的火焰海棠(Malus‘Flame’)果实是否带有苹果锈果类病毒(Apple scar skin viroid,ASSVd).[方法]提取带有“花脸”症状的火焰海棠果皮总RNA,设计ASSVd特异性引物,利用RT-PCR方法进行检测.设计基因特异性引物扩增ASSVd基因组全长,并进行克隆、测序,利用CLC RNA Workbench4预测其二级结构.用DANMAN软件比对来自中国不同地区、不同寄主的苹果锈果类病毒分离物基因序列.用MEGA-7软件分析山东火焰海棠ASSVd分离物与来自不同国家、不同寄主ASSVd分离物的遗传关系.[结果]从山东青岛采集的表现“花脸”症状的火焰海棠果皮中检测到ASSVd,推测火焰海棠果皮的“花脸”症状可能由ASSVd引起.利用基因特异性引物克隆4条ASSVd基因组全长序列,其长度为333～334 bp,在GenBank的登录号依次为MK 102981-MK 102984.ASSVd序列比对结果显示,来源于不同寄主的分离物存在差异.系统进化树显示ASSVd不存在明显的地区专化性,进一步对ASSVd二级结构分析发现不同寄主的ASSVd致病区(P)存在明显的差异.[结论]从山东青岛采集的带有“花脸”症状的火焰海棠果实带有ASSVd.本研究从火焰海棠检测到ASSVd,明确其为自然寄主之一,且火焰海棠果实的“花脸”症状形成可能与ASSVd侵染有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郝玉金		27	201	9.0	14.0
2	由春香		11	26	2.0	5.0
3	张富军		1	0	0.0	0.0
4	张振鲁		1	0	0.0	0.0
5	张蕊芬		1	0	0.0	0.0
6	王寻		1	0	0.0	0.0