短短芽孢杆菌GZDF3嗜铁素合成酶基因Gene5693的生物信息学分析及原核表达

• 作者: 刘红美 曾丽娜 王兵 盛淼淼 袁林 贾化可 隆耀航
• 来源期刊: 贵州医科大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 嗜铁素 短短芽孢杆菌 生物信息学 原核表达
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 916-920
• 页数: 5页
• 分类号: R34-33|S476
• 字数: 3500字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19367/j.cnki.1000-2707.2019.08.010

摘要

目的:从短短芽孢杆菌GZDF3菌株中克隆嗜铁素合成酶基因Gene5693,构建其原核表达载体并进行重组表达.方法:利用antiSMASH软件对GZDF3全基因组序列进行次级代谢物预测分析,然后采用ExPASy在线分析预测嗜铁素合成酶基因Gene5693的基本理化性质并进行重组表达.结果:生物信息学分析结果显示,短短芽孢杆菌GZDF3全基因组序列与Petrobactin嗜铁素基因簇的相似性为83％,Gene5693基因编码的蛋白与Petrobactin嗜铁素编码的蛋白AsbE的相似性为51.06％;Gene5693编码蛋白氨基酸长度为327个氨基酸,分子量为39.05 kDa,等电点(pI)为4.94,为酸性亲水性蛋白;Gene5693基因的PCR扩增成功获得预测的Gene5693基因片段,菌落PCR及重组DNA分子的双酶切电泳结果显示成功构建重组质粒;SDS-PAGE结果表明Gene5693编码的蛋白大小与生物信息学预测的结果一致.结论:成功克隆了嗜铁素合成基因Gene5693,并进行了重组表达.