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茶树咖啡碱合成酶基因稀有等位变异TCS1g的筛选、克隆及功能
茶树咖啡碱合成酶基因稀有等位变异TCS1g的筛选、克隆及功能
作者:
刘玉飞
姚明哲
金基强
陈亮
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
等位变异
咖啡碱合成酶
功能分析
嘌呤生物碱
茶树
摘要:
[目的]茶树咖啡碱合成酶1(TCS1)是山茶属(Camellia)茶组植物咖啡碱合成的关键酶,TCS1具有丰富的等位变异.从我国丰富的茶树种质资源中发掘TCS1稀有等位变异并研究其功能,深入解析茶树咖啡碱合成机制,为低咖啡碱育种提供新的基因资源.[方法]利用特异引物TCS1P InDe1 F/R对67 3份茶树资源中的TCS1等位变异进行鉴定;使用引物TCS1cDNAF/R,从含有新稀有等位变异的茶树资源中克隆基因的cDNA全长序列;利用生物信息学、实时荧光定量PCR (qRT-PCR)和原核表达等方法研究新发现稀有等位基因的功能.[结果]在部分大理茶(C.taliensis)资源中鉴定到一个新的TCS1稀有等位变异,命名为TCS1g.从大理茶资源‘龙陵17’(LL17,含有的TCS1等位变异为TCS1a和TCS1g)中克隆了TCS1g.TCS1g的编码区序列全长为1 098 bp,编码365个氨基酸,编码蛋白的分子量和理论等电点分别为40.9 kD和5.1.序列比对结果表明,TCS1g与TCS1a、TCS1b、TCS1c、TCS1d、TCS1e、TCS1f的相似度在94.1%-99.2%;与具有可可碱合成酶活性(TS)的TCS1b和TCS1c编码蛋白序列相似度均大于96.7%,而与同时具有TS和咖啡碱合成酶(CS)活性的TCS1a、TCS1d、TCS1e、TCS1f相似度都小于95.4%,且TCS1g第221位氨基酸残基与TCS1b、TCS1c同为组氨酸(His),而TCS1a、TCS1d、TCS1e、TCS1f为精氨酸(Arg).第221位氨基酸残基位于TCS1g蛋白活性中心,该位点的突变(His突变为Arg),可以导致TCS1g的等电点(5.05变为5.06)和亲水性(-0.119变为-0.123)发生改变.此外,5'上游调控区域的比对结果显示TCS1g、TCS1b、TCS1c起始密码子(ATG)比TCS1a、TCS1d、TCS1e、TCS1f延后了15 bp.豫该表达发现TCS1g具有TS活性,活性为44.3 pkat/mg,但未检测到CS活性.qRT-PCR的结果表明LL17中等位变异TCS1g有表达.LL17的咖啡碱和可可碱的含量分别为40.3 mg·g-1和5.4 mg·g-1.[结论]鉴定并克隆了一个新的TCS1稀有等位变异TCS1g,其在LL17中具有一定的表达水平,且其表达蛋白具有TS活性,而未检测到CS活性;推测决定TCS1g仅具有TS活性的关键位点是第221位氨基酸残基.
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文献信息
篇名
茶树咖啡碱合成酶基因稀有等位变异TCS1g的筛选、克隆及功能
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
等位变异
咖啡碱合成酶
功能分析
嘌呤生物碱
茶树
年,卷(期)
2019,(10)
所属期刊栏目
园艺
研究方向
页码范围
1772-1783
页数
12页
分类号
字数
7606字
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2019.10.010
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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